Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Atp6v0a4-202ENSMUST00000114908 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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