Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cspp1B2RX88 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms