Protein–RNA interactions for Protein: B2RUD9

Gm4787, MCG140564, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4787B2RUD9 Gm15171-201ENSMUST00000122191 334 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 Gm29747-201ENSMUST00000194764 585 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 AC129323.1-201ENSMUST00000216733 470 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 Gm14539-201ENSMUST00000117527 174 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 Gm29644-201ENSMUST00000189003 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm4787B2RUD9 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms