Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
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