Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H60cB1B213 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H60cB1B213 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H60cB1B213 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H60cB1B213 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H60cB1B213 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H60cB1B213 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms