Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms