Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lcn6A2AJB9 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Lcn6A2AJB9 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lcn6A2AJB9 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lcn6A2AJB9 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lcn6A2AJB9 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lcn6A2AJB9 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lcn6A2AJB9 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lcn6A2AJB9 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lcn6A2AJB9 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Lcn6A2AJB9 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lcn6A2AJB9 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lcn6A2AJB9 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lcn6A2AJB9 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lcn6A2AJB9 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lcn6A2AJB9 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lcn6A2AJB9 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Lcn6A2AJB9 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Lcn6A2AJB9 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lcn6A2AJB9 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lcn6A2AJB9 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lcn6A2AJB9 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lcn6A2AJB9 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lcn6A2AJB9 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lcn6A2AJB9 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Lcn6A2AJB9 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Lcn6A2AJB9 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lcn6A2AJB9 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Lcn6A2AJB9 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lcn6A2AJB9 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Lcn6A2AJB9 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lcn6A2AJB9 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Lcn6A2AJB9 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Lcn6A2AJB9 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Lcn6A2AJB9 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lcn6A2AJB9 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lcn6A2AJB9 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
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Lcn6A2AJB9 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Lcn6A2AJB9 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Lcn6A2AJB9 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lcn6A2AJB9 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lcn6A2AJB9 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lcn6A2AJB9 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Lcn6A2AJB9 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lcn6A2AJB9 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lcn6A2AJB9 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lcn6A2AJB9 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Lcn6A2AJB9 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Lcn6A2AJB9 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Lcn6A2AJB9 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Lcn6A2AJB9 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lcn6A2AJB9 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lcn6A2AJB9 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lcn6A2AJB9 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lcn6A2AJB9 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lcn6A2AJB9 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lcn6A2AJB9 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Lcn6A2AJB9 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Lcn6A2AJB9 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lcn6A2AJB9 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lcn6A2AJB9 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lcn6A2AJB9 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lcn6A2AJB9 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lcn6A2AJB9 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lcn6A2AJB9 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lcn6A2AJB9 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Lcn6A2AJB9 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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