Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
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