Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrit3W8DXL4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrit3W8DXL4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrit3W8DXL4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lrit3W8DXL4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lrit3W8DXL4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lrit3W8DXL4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lrit3W8DXL4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lrit3W8DXL4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Lrit3W8DXL4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lrit3W8DXL4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Lrit3W8DXL4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Lrit3W8DXL4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrit3W8DXL4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrit3W8DXL4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrit3W8DXL4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrit3W8DXL4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrit3W8DXL4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrit3W8DXL4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrit3W8DXL4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrit3W8DXL4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrit3W8DXL4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrit3W8DXL4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrit3W8DXL4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrit3W8DXL4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Lrit3W8DXL4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrit3W8DXL4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Lrit3W8DXL4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Lrit3W8DXL4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrit3W8DXL4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrit3W8DXL4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Lrit3W8DXL4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Lrit3W8DXL4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrit3W8DXL4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Lrit3W8DXL4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrit3W8DXL4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrit3W8DXL4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrit3W8DXL4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrit3W8DXL4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrit3W8DXL4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrit3W8DXL4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrit3W8DXL4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrit3W8DXL4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrit3W8DXL4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrit3W8DXL4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrit3W8DXL4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrit3W8DXL4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrit3W8DXL4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrit3W8DXL4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrit3W8DXL4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrit3W8DXL4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrit3W8DXL4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrit3W8DXL4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrit3W8DXL4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrit3W8DXL4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrit3W8DXL4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrit3W8DXL4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrit3W8DXL4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrit3W8DXL4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrit3W8DXL4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrit3W8DXL4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrit3W8DXL4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrit3W8DXL4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrit3W8DXL4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrit3W8DXL4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrit3W8DXL4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrit3W8DXL4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrit3W8DXL4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrit3W8DXL4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrit3W8DXL4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrit3W8DXL4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrit3W8DXL4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrit3W8DXL4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrit3W8DXL4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrit3W8DXL4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrit3W8DXL4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrit3W8DXL4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrit3W8DXL4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrit3W8DXL4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrit3W8DXL4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrit3W8DXL4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrit3W8DXL4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrit3W8DXL4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrit3W8DXL4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrit3W8DXL4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrit3W8DXL4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrit3W8DXL4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrit3W8DXL4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrit3W8DXL4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrit3W8DXL4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrit3W8DXL4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrit3W8DXL4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrit3W8DXL4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrit3W8DXL4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrit3W8DXL4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrit3W8DXL4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrit3W8DXL4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrit3W8DXL4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrit3W8DXL4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrit3W8DXL4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.2 ms