Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN8

Gm5114, MCG1026354, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5114W4VSN8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm5114W4VSN8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm5114W4VSN8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm5114W4VSN8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm5114W4VSN8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm5114W4VSN8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm5114W4VSN8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm5114W4VSN8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm5114W4VSN8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm5114W4VSN8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm5114W4VSN8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm5114W4VSN8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm5114W4VSN8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm5114W4VSN8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm5114W4VSN8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm5114W4VSN8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm5114W4VSN8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm5114W4VSN8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm5114W4VSN8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm5114W4VSN8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm5114W4VSN8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm5114W4VSN8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm5114W4VSN8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm5114W4VSN8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm5114W4VSN8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm5114W4VSN8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm5114W4VSN8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm5114W4VSN8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm5114W4VSN8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm5114W4VSN8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm5114W4VSN8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm5114W4VSN8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm5114W4VSN8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm5114W4VSN8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm5114W4VSN8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm5114W4VSN8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm5114W4VSN8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm5114W4VSN8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm5114W4VSN8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm5114W4VSN8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm5114W4VSN8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm5114W4VSN8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm5114W4VSN8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm5114W4VSN8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm5114W4VSN8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm5114W4VSN8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm5114W4VSN8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm5114W4VSN8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm5114W4VSN8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm5114W4VSN8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm5114W4VSN8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm5114W4VSN8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm5114W4VSN8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm5114W4VSN8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm5114W4VSN8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm5114W4VSN8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm5114W4VSN8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm5114W4VSN8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm5114W4VSN8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm5114W4VSN8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm5114W4VSN8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm5114W4VSN8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm5114W4VSN8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm5114W4VSN8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm5114W4VSN8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm5114W4VSN8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm5114W4VSN8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm5114W4VSN8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm5114W4VSN8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm5114W4VSN8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm5114W4VSN8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm5114W4VSN8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm5114W4VSN8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm5114W4VSN8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm5114W4VSN8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm5114W4VSN8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm5114W4VSN8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm5114W4VSN8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm5114W4VSN8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm5114W4VSN8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm5114W4VSN8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm5114W4VSN8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm5114W4VSN8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm5114W4VSN8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm5114W4VSN8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm5114W4VSN8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm5114W4VSN8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm5114W4VSN8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm5114W4VSN8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm5114W4VSN8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm5114W4VSN8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm5114W4VSN8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm5114W4VSN8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm5114W4VSN8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm5114W4VSN8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm5114W4VSN8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm5114W4VSN8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm5114W4VSN8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm5114W4VSN8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm5114W4VSN8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms