Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3550W4VSN7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3550W4VSN7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3550W4VSN7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3550W4VSN7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3550W4VSN7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3550W4VSN7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3550W4VSN7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3550W4VSN7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3550W4VSN7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3550W4VSN7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3550W4VSN7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3550W4VSN7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3550W4VSN7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3550W4VSN7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3550W4VSN7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3550W4VSN7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3550W4VSN7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3550W4VSN7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3550W4VSN7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3550W4VSN7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3550W4VSN7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3550W4VSN7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3550W4VSN7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3550W4VSN7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3550W4VSN7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3550W4VSN7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3550W4VSN7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3550W4VSN7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3550W4VSN7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3550W4VSN7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3550W4VSN7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3550W4VSN7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3550W4VSN7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3550W4VSN7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3550W4VSN7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3550W4VSN7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3550W4VSN7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3550W4VSN7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3550W4VSN7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3550W4VSN7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3550W4VSN7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3550W4VSN7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3550W4VSN7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3550W4VSN7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3550W4VSN7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3550W4VSN7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3550W4VSN7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3550W4VSN7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3550W4VSN7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3550W4VSN7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3550W4VSN7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3550W4VSN7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3550W4VSN7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3550W4VSN7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3550W4VSN7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3550W4VSN7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3550W4VSN7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3550W4VSN7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3550W4VSN7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3550W4VSN7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3550W4VSN7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3550W4VSN7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3550W4VSN7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3550W4VSN7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3550W4VSN7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3550W4VSN7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3550W4VSN7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3550W4VSN7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3550W4VSN7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3550W4VSN7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3550W4VSN7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3550W4VSN7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3550W4VSN7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3550W4VSN7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3550W4VSN7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3550W4VSN7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3550W4VSN7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3550W4VSN7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3550W4VSN7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3550W4VSN7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3550W4VSN7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3550W4VSN7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3550W4VSN7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3550W4VSN7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3550W4VSN7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3550W4VSN7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3550W4VSN7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3550W4VSN7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3550W4VSN7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3550W4VSN7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3550W4VSN7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3550W4VSN7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3550W4VSN7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3550W4VSN7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3550W4VSN7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3550W4VSN7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm3550W4VSN7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm3550W4VSN7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm3550W4VSN7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms