Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Homer1Q9Z2Y3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Homer1Q9Z2Y3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Homer1Q9Z2Y3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Homer1Q9Z2Y3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Homer1Q9Z2Y3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Homer1Q9Z2Y3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Homer1Q9Z2Y3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Homer1Q9Z2Y3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Homer1Q9Z2Y3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Homer1Q9Z2Y3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Homer1Q9Z2Y3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Homer1Q9Z2Y3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Homer1Q9Z2Y3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Homer1Q9Z2Y3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Homer1Q9Z2Y3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Homer1Q9Z2Y3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Homer1Q9Z2Y3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Homer1Q9Z2Y3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Homer1Q9Z2Y3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Homer1Q9Z2Y3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Homer1Q9Z2Y3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Homer1Q9Z2Y3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Homer1Q9Z2Y3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Homer1Q9Z2Y3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Homer1Q9Z2Y3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Homer1Q9Z2Y3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Homer1Q9Z2Y3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Homer1Q9Z2Y3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Homer1Q9Z2Y3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Homer1Q9Z2Y3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Homer1Q9Z2Y3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Homer1Q9Z2Y3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Homer1Q9Z2Y3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Homer1Q9Z2Y3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Homer1Q9Z2Y3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Homer1Q9Z2Y3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Homer1Q9Z2Y3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Homer1Q9Z2Y3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Homer1Q9Z2Y3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Homer1Q9Z2Y3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Homer1Q9Z2Y3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Homer1Q9Z2Y3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Homer1Q9Z2Y3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Homer1Q9Z2Y3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Homer1Q9Z2Y3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Homer1Q9Z2Y3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Homer1Q9Z2Y3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Homer1Q9Z2Y3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Homer1Q9Z2Y3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Homer1Q9Z2Y3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Homer1Q9Z2Y3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Homer1Q9Z2Y3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Homer1Q9Z2Y3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Homer1Q9Z2Y3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Homer1Q9Z2Y3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Homer1Q9Z2Y3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Homer1Q9Z2Y3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Homer1Q9Z2Y3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Homer1Q9Z2Y3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Homer1Q9Z2Y3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Homer1Q9Z2Y3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Homer1Q9Z2Y3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Homer1Q9Z2Y3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Homer1Q9Z2Y3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Homer1Q9Z2Y3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Homer1Q9Z2Y3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Homer1Q9Z2Y3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Homer1Q9Z2Y3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Homer1Q9Z2Y3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Homer1Q9Z2Y3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Homer1Q9Z2Y3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Homer1Q9Z2Y3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Homer1Q9Z2Y3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Homer1Q9Z2Y3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Homer1Q9Z2Y3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Homer1Q9Z2Y3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Homer1Q9Z2Y3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Homer1Q9Z2Y3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Homer1Q9Z2Y3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Homer1Q9Z2Y3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Homer1Q9Z2Y3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Homer1Q9Z2Y3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Homer1Q9Z2Y3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Homer1Q9Z2Y3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Homer1Q9Z2Y3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Homer1Q9Z2Y3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Homer1Q9Z2Y3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Homer1Q9Z2Y3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Homer1Q9Z2Y3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Homer1Q9Z2Y3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Homer1Q9Z2Y3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Homer1Q9Z2Y3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Homer1Q9Z2Y3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Homer1Q9Z2Y3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Homer1Q9Z2Y3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Homer1Q9Z2Y3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Homer1Q9Z2Y3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Homer1Q9Z2Y3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Homer1Q9Z2Y3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms