Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Hdac5Q9Z2V6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Hdac5Q9Z2V6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Hdac5Q9Z2V6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Hdac5Q9Z2V6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Hdac5Q9Z2V6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Hdac5Q9Z2V6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Hdac5Q9Z2V6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Hdac5Q9Z2V6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Hdac5Q9Z2V6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Hdac5Q9Z2V6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Hdac5Q9Z2V6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Hdac5Q9Z2V6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Hdac5Q9Z2V6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Hdac5Q9Z2V6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Hdac5Q9Z2V6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Hdac5Q9Z2V6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Hdac5Q9Z2V6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Hdac5Q9Z2V6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Hdac5Q9Z2V6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Hdac5Q9Z2V6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Hdac5Q9Z2V6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Hdac5Q9Z2V6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Hdac5Q9Z2V6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Hdac5Q9Z2V6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Hdac5Q9Z2V6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Hdac5Q9Z2V6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Hdac5Q9Z2V6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Hdac5Q9Z2V6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Hdac5Q9Z2V6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Hdac5Q9Z2V6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Hdac5Q9Z2V6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Hdac5Q9Z2V6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Hdac5Q9Z2V6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Hdac5Q9Z2V6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Hdac5Q9Z2V6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Hdac5Q9Z2V6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Hdac5Q9Z2V6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Hdac5Q9Z2V6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Hdac5Q9Z2V6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Hdac5Q9Z2V6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Hdac5Q9Z2V6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Hdac5Q9Z2V6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Hdac5Q9Z2V6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Hdac5Q9Z2V6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Hdac5Q9Z2V6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Hdac5Q9Z2V6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Hdac5Q9Z2V6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Hdac5Q9Z2V6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Hdac5Q9Z2V6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Hdac5Q9Z2V6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Hdac5Q9Z2V6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Hdac5Q9Z2V6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Hdac5Q9Z2V6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Hdac5Q9Z2V6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Hdac5Q9Z2V6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Hdac5Q9Z2V6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Hdac5Q9Z2V6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Hdac5Q9Z2V6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Hdac5Q9Z2V6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Hdac5Q9Z2V6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Hdac5Q9Z2V6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Hdac5Q9Z2V6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Hdac5Q9Z2V6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Hdac5Q9Z2V6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Hdac5Q9Z2V6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Hdac5Q9Z2V6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Hdac5Q9Z2V6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Hdac5Q9Z2V6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Hdac5Q9Z2V6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Hdac5Q9Z2V6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Hdac5Q9Z2V6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Hdac5Q9Z2V6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Hdac5Q9Z2V6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Hdac5Q9Z2V6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Hdac5Q9Z2V6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Hdac5Q9Z2V6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Hdac5Q9Z2V6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Hdac5Q9Z2V6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Hdac5Q9Z2V6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Hdac5Q9Z2V6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Hdac5Q9Z2V6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Hdac5Q9Z2V6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Hdac5Q9Z2V6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Hdac5Q9Z2V6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Hdac5Q9Z2V6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Hdac5Q9Z2V6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Hdac5Q9Z2V6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Hdac5Q9Z2V6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Hdac5Q9Z2V6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Hdac5Q9Z2V6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Hdac5Q9Z2V6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Hdac5Q9Z2V6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Hdac5Q9Z2V6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Hdac5Q9Z2V6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Hdac5Q9Z2V6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Hdac5Q9Z2V6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Hdac5Q9Z2V6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Hdac5Q9Z2V6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Hdac5Q9Z2V6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms