Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I4

Robo3, Roundabout homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo3Q9Z2I4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Robo3Q9Z2I4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Robo3Q9Z2I4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Robo3Q9Z2I4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Robo3Q9Z2I4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Robo3Q9Z2I4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Robo3Q9Z2I4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Robo3Q9Z2I4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Robo3Q9Z2I4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Robo3Q9Z2I4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Robo3Q9Z2I4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Robo3Q9Z2I4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Robo3Q9Z2I4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Robo3Q9Z2I4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Robo3Q9Z2I4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Robo3Q9Z2I4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Robo3Q9Z2I4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Robo3Q9Z2I4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Robo3Q9Z2I4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Robo3Q9Z2I4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Robo3Q9Z2I4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Robo3Q9Z2I4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Robo3Q9Z2I4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Robo3Q9Z2I4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Robo3Q9Z2I4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Robo3Q9Z2I4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Robo3Q9Z2I4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Robo3Q9Z2I4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Robo3Q9Z2I4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Robo3Q9Z2I4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Robo3Q9Z2I4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Robo3Q9Z2I4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Robo3Q9Z2I4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Robo3Q9Z2I4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Robo3Q9Z2I4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Robo3Q9Z2I4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Robo3Q9Z2I4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Robo3Q9Z2I4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Robo3Q9Z2I4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Robo3Q9Z2I4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Robo3Q9Z2I4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Robo3Q9Z2I4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Robo3Q9Z2I4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Robo3Q9Z2I4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Robo3Q9Z2I4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Robo3Q9Z2I4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Robo3Q9Z2I4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Robo3Q9Z2I4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Robo3Q9Z2I4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Robo3Q9Z2I4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Robo3Q9Z2I4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Robo3Q9Z2I4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Robo3Q9Z2I4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Robo3Q9Z2I4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Robo3Q9Z2I4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Robo3Q9Z2I4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Robo3Q9Z2I4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Robo3Q9Z2I4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Robo3Q9Z2I4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Robo3Q9Z2I4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Robo3Q9Z2I4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Robo3Q9Z2I4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Robo3Q9Z2I4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Robo3Q9Z2I4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Robo3Q9Z2I4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Robo3Q9Z2I4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Robo3Q9Z2I4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Robo3Q9Z2I4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Robo3Q9Z2I4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Robo3Q9Z2I4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Robo3Q9Z2I4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Robo3Q9Z2I4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Robo3Q9Z2I4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Robo3Q9Z2I4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Robo3Q9Z2I4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Robo3Q9Z2I4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Robo3Q9Z2I4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Robo3Q9Z2I4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Robo3Q9Z2I4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Robo3Q9Z2I4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Robo3Q9Z2I4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Robo3Q9Z2I4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Robo3Q9Z2I4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Robo3Q9Z2I4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Robo3Q9Z2I4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Robo3Q9Z2I4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Robo3Q9Z2I4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Robo3Q9Z2I4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Robo3Q9Z2I4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Robo3Q9Z2I4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Robo3Q9Z2I4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Robo3Q9Z2I4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Robo3Q9Z2I4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Robo3Q9Z2I4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Robo3Q9Z2I4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Robo3Q9Z2I4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Robo3Q9Z2I4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Robo3Q9Z2I4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Robo3Q9Z2I4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Robo3Q9Z2I4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.6 ms