Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A5

Ate1, Arginyl-tRNA--protein transferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ate1Q9Z2A5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ate1Q9Z2A5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ate1Q9Z2A5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ate1Q9Z2A5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ate1Q9Z2A5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ate1Q9Z2A5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ate1Q9Z2A5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ate1Q9Z2A5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ate1Q9Z2A5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ate1Q9Z2A5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ate1Q9Z2A5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ate1Q9Z2A5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ate1Q9Z2A5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ate1Q9Z2A5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ate1Q9Z2A5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ate1Q9Z2A5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ate1Q9Z2A5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ate1Q9Z2A5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ate1Q9Z2A5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ate1Q9Z2A5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ate1Q9Z2A5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ate1Q9Z2A5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ate1Q9Z2A5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ate1Q9Z2A5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ate1Q9Z2A5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ate1Q9Z2A5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ate1Q9Z2A5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ate1Q9Z2A5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ate1Q9Z2A5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ate1Q9Z2A5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ate1Q9Z2A5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ate1Q9Z2A5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ate1Q9Z2A5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ate1Q9Z2A5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ate1Q9Z2A5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ate1Q9Z2A5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ate1Q9Z2A5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ate1Q9Z2A5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ate1Q9Z2A5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ate1Q9Z2A5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ate1Q9Z2A5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ate1Q9Z2A5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ate1Q9Z2A5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ate1Q9Z2A5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ate1Q9Z2A5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ate1Q9Z2A5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ate1Q9Z2A5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ate1Q9Z2A5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ate1Q9Z2A5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ate1Q9Z2A5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ate1Q9Z2A5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ate1Q9Z2A5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ate1Q9Z2A5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ate1Q9Z2A5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ate1Q9Z2A5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ate1Q9Z2A5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ate1Q9Z2A5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ate1Q9Z2A5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ate1Q9Z2A5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ate1Q9Z2A5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ate1Q9Z2A5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ate1Q9Z2A5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ate1Q9Z2A5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ate1Q9Z2A5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ate1Q9Z2A5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ate1Q9Z2A5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ate1Q9Z2A5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ate1Q9Z2A5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ate1Q9Z2A5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ate1Q9Z2A5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ate1Q9Z2A5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ate1Q9Z2A5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ate1Q9Z2A5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ate1Q9Z2A5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ate1Q9Z2A5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ate1Q9Z2A5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ate1Q9Z2A5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ate1Q9Z2A5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ate1Q9Z2A5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ate1Q9Z2A5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ate1Q9Z2A5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ate1Q9Z2A5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ate1Q9Z2A5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ate1Q9Z2A5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ate1Q9Z2A5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ate1Q9Z2A5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ate1Q9Z2A5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ate1Q9Z2A5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ate1Q9Z2A5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ate1Q9Z2A5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ate1Q9Z2A5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ate1Q9Z2A5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ate1Q9Z2A5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ate1Q9Z2A5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ate1Q9Z2A5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ate1Q9Z2A5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ate1Q9Z2A5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ate1Q9Z2A5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ate1Q9Z2A5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ate1Q9Z2A5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms