Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L4

Rs1, Retinoschisin, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rs1Q9Z1L4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rs1Q9Z1L4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rs1Q9Z1L4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rs1Q9Z1L4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rs1Q9Z1L4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rs1Q9Z1L4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rs1Q9Z1L4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rs1Q9Z1L4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rs1Q9Z1L4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rs1Q9Z1L4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rs1Q9Z1L4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rs1Q9Z1L4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rs1Q9Z1L4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rs1Q9Z1L4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rs1Q9Z1L4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rs1Q9Z1L4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rs1Q9Z1L4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rs1Q9Z1L4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rs1Q9Z1L4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rs1Q9Z1L4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rs1Q9Z1L4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rs1Q9Z1L4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rs1Q9Z1L4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rs1Q9Z1L4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rs1Q9Z1L4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rs1Q9Z1L4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rs1Q9Z1L4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rs1Q9Z1L4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rs1Q9Z1L4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rs1Q9Z1L4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rs1Q9Z1L4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rs1Q9Z1L4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rs1Q9Z1L4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rs1Q9Z1L4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rs1Q9Z1L4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rs1Q9Z1L4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rs1Q9Z1L4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rs1Q9Z1L4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rs1Q9Z1L4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rs1Q9Z1L4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rs1Q9Z1L4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rs1Q9Z1L4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rs1Q9Z1L4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rs1Q9Z1L4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rs1Q9Z1L4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rs1Q9Z1L4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rs1Q9Z1L4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rs1Q9Z1L4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rs1Q9Z1L4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rs1Q9Z1L4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rs1Q9Z1L4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rs1Q9Z1L4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rs1Q9Z1L4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rs1Q9Z1L4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rs1Q9Z1L4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rs1Q9Z1L4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rs1Q9Z1L4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rs1Q9Z1L4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rs1Q9Z1L4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rs1Q9Z1L4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rs1Q9Z1L4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rs1Q9Z1L4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rs1Q9Z1L4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rs1Q9Z1L4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rs1Q9Z1L4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rs1Q9Z1L4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rs1Q9Z1L4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rs1Q9Z1L4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rs1Q9Z1L4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rs1Q9Z1L4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rs1Q9Z1L4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rs1Q9Z1L4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rs1Q9Z1L4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms