Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVP6

Papolb, Poly(A) polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolbQ9WVP6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PapolbQ9WVP6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PapolbQ9WVP6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PapolbQ9WVP6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PapolbQ9WVP6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PapolbQ9WVP6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PapolbQ9WVP6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PapolbQ9WVP6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PapolbQ9WVP6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PapolbQ9WVP6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PapolbQ9WVP6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PapolbQ9WVP6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PapolbQ9WVP6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PapolbQ9WVP6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PapolbQ9WVP6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PapolbQ9WVP6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PapolbQ9WVP6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PapolbQ9WVP6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PapolbQ9WVP6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PapolbQ9WVP6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PapolbQ9WVP6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PapolbQ9WVP6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PapolbQ9WVP6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PapolbQ9WVP6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PapolbQ9WVP6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PapolbQ9WVP6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PapolbQ9WVP6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PapolbQ9WVP6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PapolbQ9WVP6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PapolbQ9WVP6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PapolbQ9WVP6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PapolbQ9WVP6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PapolbQ9WVP6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PapolbQ9WVP6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PapolbQ9WVP6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PapolbQ9WVP6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PapolbQ9WVP6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PapolbQ9WVP6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PapolbQ9WVP6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PapolbQ9WVP6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PapolbQ9WVP6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PapolbQ9WVP6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PapolbQ9WVP6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PapolbQ9WVP6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PapolbQ9WVP6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PapolbQ9WVP6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PapolbQ9WVP6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PapolbQ9WVP6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PapolbQ9WVP6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PapolbQ9WVP6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PapolbQ9WVP6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PapolbQ9WVP6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PapolbQ9WVP6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PapolbQ9WVP6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PapolbQ9WVP6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PapolbQ9WVP6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PapolbQ9WVP6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PapolbQ9WVP6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PapolbQ9WVP6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PapolbQ9WVP6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PapolbQ9WVP6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PapolbQ9WVP6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PapolbQ9WVP6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PapolbQ9WVP6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PapolbQ9WVP6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PapolbQ9WVP6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PapolbQ9WVP6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PapolbQ9WVP6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PapolbQ9WVP6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PapolbQ9WVP6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PapolbQ9WVP6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PapolbQ9WVP6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PapolbQ9WVP6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PapolbQ9WVP6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PapolbQ9WVP6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PapolbQ9WVP6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PapolbQ9WVP6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PapolbQ9WVP6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PapolbQ9WVP6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PapolbQ9WVP6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PapolbQ9WVP6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PapolbQ9WVP6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PapolbQ9WVP6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PapolbQ9WVP6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PapolbQ9WVP6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PapolbQ9WVP6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PapolbQ9WVP6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PapolbQ9WVP6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PapolbQ9WVP6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PapolbQ9WVP6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PapolbQ9WVP6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PapolbQ9WVP6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PapolbQ9WVP6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PapolbQ9WVP6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PapolbQ9WVP6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PapolbQ9WVP6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PapolbQ9WVP6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PapolbQ9WVP6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PapolbQ9WVP6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PapolbQ9WVP6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms