Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVF8

Tusc2, Tumor suppressor candidate 2, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tusc2Q9WVF8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tusc2Q9WVF8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tusc2Q9WVF8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tusc2Q9WVF8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tusc2Q9WVF8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tusc2Q9WVF8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tusc2Q9WVF8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tusc2Q9WVF8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tusc2Q9WVF8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Tusc2Q9WVF8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tusc2Q9WVF8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tusc2Q9WVF8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tusc2Q9WVF8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tusc2Q9WVF8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tusc2Q9WVF8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tusc2Q9WVF8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tusc2Q9WVF8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tusc2Q9WVF8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tusc2Q9WVF8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Tusc2Q9WVF8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Tusc2Q9WVF8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tusc2Q9WVF8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tusc2Q9WVF8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tusc2Q9WVF8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tusc2Q9WVF8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tusc2Q9WVF8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tusc2Q9WVF8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Tusc2Q9WVF8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tusc2Q9WVF8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tusc2Q9WVF8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tusc2Q9WVF8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Tusc2Q9WVF8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tusc2Q9WVF8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tusc2Q9WVF8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tusc2Q9WVF8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tusc2Q9WVF8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tusc2Q9WVF8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tusc2Q9WVF8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tusc2Q9WVF8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tusc2Q9WVF8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tusc2Q9WVF8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Tusc2Q9WVF8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tusc2Q9WVF8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tusc2Q9WVF8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tusc2Q9WVF8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tusc2Q9WVF8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tusc2Q9WVF8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tusc2Q9WVF8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tusc2Q9WVF8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tusc2Q9WVF8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tusc2Q9WVF8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Tusc2Q9WVF8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tusc2Q9WVF8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tusc2Q9WVF8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tusc2Q9WVF8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tusc2Q9WVF8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tusc2Q9WVF8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tusc2Q9WVF8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tusc2Q9WVF8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tusc2Q9WVF8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tusc2Q9WVF8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tusc2Q9WVF8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tusc2Q9WVF8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tusc2Q9WVF8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tusc2Q9WVF8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tusc2Q9WVF8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tusc2Q9WVF8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tusc2Q9WVF8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tusc2Q9WVF8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tusc2Q9WVF8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tusc2Q9WVF8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tusc2Q9WVF8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tusc2Q9WVF8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tusc2Q9WVF8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tusc2Q9WVF8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Tusc2Q9WVF8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tusc2Q9WVF8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tusc2Q9WVF8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Tusc2Q9WVF8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tusc2Q9WVF8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tusc2Q9WVF8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tusc2Q9WVF8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tusc2Q9WVF8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Tusc2Q9WVF8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tusc2Q9WVF8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tusc2Q9WVF8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tusc2Q9WVF8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tusc2Q9WVF8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tusc2Q9WVF8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tusc2Q9WVF8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tusc2Q9WVF8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tusc2Q9WVF8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tusc2Q9WVF8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tusc2Q9WVF8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tusc2Q9WVF8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tusc2Q9WVF8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tusc2Q9WVF8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tusc2Q9WVF8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tusc2Q9WVF8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tusc2Q9WVF8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms