Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnip1Q9WUU8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnip1Q9WUU8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnip1Q9WUU8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnip1Q9WUU8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnip1Q9WUU8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnip1Q9WUU8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnip1Q9WUU8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnip1Q9WUU8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnip1Q9WUU8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnip1Q9WUU8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnip1Q9WUU8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnip1Q9WUU8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnip1Q9WUU8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnip1Q9WUU8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnip1Q9WUU8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnip1Q9WUU8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnip1Q9WUU8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnip1Q9WUU8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnip1Q9WUU8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnip1Q9WUU8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnip1Q9WUU8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnip1Q9WUU8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Tnip1Q9WUU8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnip1Q9WUU8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnip1Q9WUU8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnip1Q9WUU8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnip1Q9WUU8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnip1Q9WUU8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnip1Q9WUU8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnip1Q9WUU8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnip1Q9WUU8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnip1Q9WUU8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnip1Q9WUU8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnip1Q9WUU8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnip1Q9WUU8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnip1Q9WUU8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnip1Q9WUU8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnip1Q9WUU8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnip1Q9WUU8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnip1Q9WUU8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnip1Q9WUU8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnip1Q9WUU8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnip1Q9WUU8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnip1Q9WUU8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnip1Q9WUU8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnip1Q9WUU8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnip1Q9WUU8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnip1Q9WUU8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnip1Q9WUU8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnip1Q9WUU8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnip1Q9WUU8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnip1Q9WUU8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnip1Q9WUU8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnip1Q9WUU8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnip1Q9WUU8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnip1Q9WUU8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnip1Q9WUU8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnip1Q9WUU8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnip1Q9WUU8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnip1Q9WUU8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnip1Q9WUU8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnip1Q9WUU8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnip1Q9WUU8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnip1Q9WUU8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnip1Q9WUU8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnip1Q9WUU8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnip1Q9WUU8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnip1Q9WUU8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnip1Q9WUU8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tnip1Q9WUU8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnip1Q9WUU8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnip1Q9WUU8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnip1Q9WUU8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnip1Q9WUU8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnip1Q9WUU8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnip1Q9WUU8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnip1Q9WUU8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnip1Q9WUU8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnip1Q9WUU8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnip1Q9WUU8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnip1Q9WUU8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnip1Q9WUU8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnip1Q9WUU8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnip1Q9WUU8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnip1Q9WUU8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnip1Q9WUU8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnip1Q9WUU8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnip1Q9WUU8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnip1Q9WUU8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnip1Q9WUU8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnip1Q9WUU8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnip1Q9WUU8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnip1Q9WUU8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnip1Q9WUU8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnip1Q9WUU8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnip1Q9WUU8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnip1Q9WUU8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnip1Q9WUU8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnip1Q9WUU8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms