Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnfsf13bQ9WU72 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnfsf13bQ9WU72 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnfsf13bQ9WU72 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnfsf13bQ9WU72 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnfsf13bQ9WU72 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnfsf13bQ9WU72 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnfsf13bQ9WU72 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnfsf13bQ9WU72 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tnfsf13bQ9WU72 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tnfsf13bQ9WU72 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnfsf13bQ9WU72 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnfsf13bQ9WU72 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnfsf13bQ9WU72 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnfsf13bQ9WU72 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnfsf13bQ9WU72 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnfsf13bQ9WU72 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnfsf13bQ9WU72 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnfsf13bQ9WU72 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnfsf13bQ9WU72 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnfsf13bQ9WU72 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnfsf13bQ9WU72 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnfsf13bQ9WU72 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnfsf13bQ9WU72 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnfsf13bQ9WU72 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnfsf13bQ9WU72 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnfsf13bQ9WU72 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnfsf13bQ9WU72 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnfsf13bQ9WU72 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnfsf13bQ9WU72 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnfsf13bQ9WU72 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnfsf13bQ9WU72 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnfsf13bQ9WU72 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnfsf13bQ9WU72 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnfsf13bQ9WU72 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnfsf13bQ9WU72 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnfsf13bQ9WU72 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnfsf13bQ9WU72 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnfsf13bQ9WU72 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnfsf13bQ9WU72 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnfsf13bQ9WU72 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnfsf13bQ9WU72 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnfsf13bQ9WU72 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnfsf13bQ9WU72 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnfsf13bQ9WU72 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnfsf13bQ9WU72 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnfsf13bQ9WU72 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnfsf13bQ9WU72 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnfsf13bQ9WU72 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnfsf13bQ9WU72 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnfsf13bQ9WU72 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnfsf13bQ9WU72 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnfsf13bQ9WU72 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnfsf13bQ9WU72 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnfsf13bQ9WU72 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnfsf13bQ9WU72 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnfsf13bQ9WU72 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnfsf13bQ9WU72 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnfsf13bQ9WU72 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnfsf13bQ9WU72 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnfsf13bQ9WU72 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnfsf13bQ9WU72 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnfsf13bQ9WU72 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnfsf13bQ9WU72 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnfsf13bQ9WU72 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnfsf13bQ9WU72 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnfsf13bQ9WU72 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnfsf13bQ9WU72 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnfsf13bQ9WU72 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tnfsf13bQ9WU72 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tnfsf13bQ9WU72 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnfsf13bQ9WU72 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnfsf13bQ9WU72 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnfsf13bQ9WU72 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnfsf13bQ9WU72 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnfsf13bQ9WU72 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnfsf13bQ9WU72 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnfsf13bQ9WU72 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnfsf13bQ9WU72 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnfsf13bQ9WU72 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnfsf13bQ9WU72 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnfsf13bQ9WU72 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnfsf13bQ9WU72 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnfsf13bQ9WU72 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnfsf13bQ9WU72 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnfsf13bQ9WU72 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnfsf13bQ9WU72 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnfsf13bQ9WU72 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnfsf13bQ9WU72 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnfsf13bQ9WU72 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnfsf13bQ9WU72 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnfsf13bQ9WU72 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnfsf13bQ9WU72 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnfsf13bQ9WU72 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnfsf13bQ9WU72 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnfsf13bQ9WU72 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnfsf13bQ9WU72 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnfsf13bQ9WU72 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnfsf13bQ9WU72 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms