Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scnn1bQ9WU38 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scnn1bQ9WU38 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scnn1bQ9WU38 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scnn1bQ9WU38 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scnn1bQ9WU38 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scnn1bQ9WU38 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scnn1bQ9WU38 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scnn1bQ9WU38 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scnn1bQ9WU38 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scnn1bQ9WU38 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scnn1bQ9WU38 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scnn1bQ9WU38 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scnn1bQ9WU38 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scnn1bQ9WU38 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scnn1bQ9WU38 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scnn1bQ9WU38 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scnn1bQ9WU38 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scnn1bQ9WU38 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scnn1bQ9WU38 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Scnn1bQ9WU38 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scnn1bQ9WU38 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scnn1bQ9WU38 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scnn1bQ9WU38 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scnn1bQ9WU38 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scnn1bQ9WU38 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scnn1bQ9WU38 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scnn1bQ9WU38 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scnn1bQ9WU38 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scnn1bQ9WU38 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scnn1bQ9WU38 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scnn1bQ9WU38 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scnn1bQ9WU38 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scnn1bQ9WU38 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scnn1bQ9WU38 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scnn1bQ9WU38 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scnn1bQ9WU38 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scnn1bQ9WU38 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scnn1bQ9WU38 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scnn1bQ9WU38 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scnn1bQ9WU38 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scnn1bQ9WU38 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scnn1bQ9WU38 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scnn1bQ9WU38 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scnn1bQ9WU38 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scnn1bQ9WU38 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scnn1bQ9WU38 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scnn1bQ9WU38 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scnn1bQ9WU38 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scnn1bQ9WU38 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scnn1bQ9WU38 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scnn1bQ9WU38 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scnn1bQ9WU38 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scnn1bQ9WU38 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scnn1bQ9WU38 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scnn1bQ9WU38 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scnn1bQ9WU38 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scnn1bQ9WU38 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scnn1bQ9WU38 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scnn1bQ9WU38 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scnn1bQ9WU38 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Scnn1bQ9WU38 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scnn1bQ9WU38 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scnn1bQ9WU38 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scnn1bQ9WU38 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Scnn1bQ9WU38 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scnn1bQ9WU38 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scnn1bQ9WU38 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Scnn1bQ9WU38 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scnn1bQ9WU38 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scnn1bQ9WU38 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scnn1bQ9WU38 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scnn1bQ9WU38 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scnn1bQ9WU38 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scnn1bQ9WU38 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scnn1bQ9WU38 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scnn1bQ9WU38 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scnn1bQ9WU38 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scnn1bQ9WU38 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scnn1bQ9WU38 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scnn1bQ9WU38 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scnn1bQ9WU38 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scnn1bQ9WU38 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scnn1bQ9WU38 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scnn1bQ9WU38 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scnn1bQ9WU38 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scnn1bQ9WU38 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scnn1bQ9WU38 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scnn1bQ9WU38 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scnn1bQ9WU38 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scnn1bQ9WU38 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scnn1bQ9WU38 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scnn1bQ9WU38 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Scnn1bQ9WU38 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scnn1bQ9WU38 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scnn1bQ9WU38 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scnn1bQ9WU38 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scnn1bQ9WU38 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Scnn1bQ9WU38 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scnn1bQ9WU38 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms