Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX6

Cul1, Cullin-1, mousemouse

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul1Q9WTX6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cul1Q9WTX6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cul1Q9WTX6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cul1Q9WTX6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cul1Q9WTX6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cul1Q9WTX6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cul1Q9WTX6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cul1Q9WTX6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cul1Q9WTX6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cul1Q9WTX6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cul1Q9WTX6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cul1Q9WTX6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cul1Q9WTX6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cul1Q9WTX6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cul1Q9WTX6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cul1Q9WTX6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cul1Q9WTX6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cul1Q9WTX6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cul1Q9WTX6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cul1Q9WTX6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cul1Q9WTX6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cul1Q9WTX6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cul1Q9WTX6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cul1Q9WTX6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cul1Q9WTX6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cul1Q9WTX6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cul1Q9WTX6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cul1Q9WTX6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cul1Q9WTX6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cul1Q9WTX6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cul1Q9WTX6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cul1Q9WTX6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cul1Q9WTX6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cul1Q9WTX6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cul1Q9WTX6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cul1Q9WTX6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cul1Q9WTX6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cul1Q9WTX6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cul1Q9WTX6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cul1Q9WTX6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Cul1Q9WTX6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cul1Q9WTX6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cul1Q9WTX6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cul1Q9WTX6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cul1Q9WTX6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cul1Q9WTX6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cul1Q9WTX6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cul1Q9WTX6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cul1Q9WTX6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cul1Q9WTX6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cul1Q9WTX6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cul1Q9WTX6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Cul1Q9WTX6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cul1Q9WTX6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cul1Q9WTX6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cul1Q9WTX6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cul1Q9WTX6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cul1Q9WTX6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cul1Q9WTX6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cul1Q9WTX6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cul1Q9WTX6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cul1Q9WTX6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cul1Q9WTX6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cul1Q9WTX6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cul1Q9WTX6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cul1Q9WTX6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cul1Q9WTX6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cul1Q9WTX6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cul1Q9WTX6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cul1Q9WTX6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cul1Q9WTX6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cul1Q9WTX6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cul1Q9WTX6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cul1Q9WTX6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cul1Q9WTX6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cul1Q9WTX6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cul1Q9WTX6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cul1Q9WTX6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cul1Q9WTX6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cul1Q9WTX6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cul1Q9WTX6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cul1Q9WTX6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cul1Q9WTX6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cul1Q9WTX6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cul1Q9WTX6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Cul1Q9WTX6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cul1Q9WTX6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cul1Q9WTX6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cul1Q9WTX6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cul1Q9WTX6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cul1Q9WTX6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cul1Q9WTX6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cul1Q9WTX6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cul1Q9WTX6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cul1Q9WTX6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cul1Q9WTX6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cul1Q9WTX6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cul1Q9WTX6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cul1Q9WTX6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cul1Q9WTX6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms