Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX5

Skp1, S-phase kinase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp1Q9WTX5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Skp1Q9WTX5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Skp1Q9WTX5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Skp1Q9WTX5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Skp1Q9WTX5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Skp1Q9WTX5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Skp1Q9WTX5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Skp1Q9WTX5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Skp1Q9WTX5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Skp1Q9WTX5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Skp1Q9WTX5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Skp1Q9WTX5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Skp1Q9WTX5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Skp1Q9WTX5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Skp1Q9WTX5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Skp1Q9WTX5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Skp1Q9WTX5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Skp1Q9WTX5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Skp1Q9WTX5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Skp1Q9WTX5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Skp1Q9WTX5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Skp1Q9WTX5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Skp1Q9WTX5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Skp1Q9WTX5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Skp1Q9WTX5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Skp1Q9WTX5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Skp1Q9WTX5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Skp1Q9WTX5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Skp1Q9WTX5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Skp1Q9WTX5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Skp1Q9WTX5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Skp1Q9WTX5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Skp1Q9WTX5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Skp1Q9WTX5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Skp1Q9WTX5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Skp1Q9WTX5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Skp1Q9WTX5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Skp1Q9WTX5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Skp1Q9WTX5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Skp1Q9WTX5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Skp1Q9WTX5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Skp1Q9WTX5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Skp1Q9WTX5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Skp1Q9WTX5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Skp1Q9WTX5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Skp1Q9WTX5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Skp1Q9WTX5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Skp1Q9WTX5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Skp1Q9WTX5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Skp1Q9WTX5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Skp1Q9WTX5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Skp1Q9WTX5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Skp1Q9WTX5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Skp1Q9WTX5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Skp1Q9WTX5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Skp1Q9WTX5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Skp1Q9WTX5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Skp1Q9WTX5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Skp1Q9WTX5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Skp1Q9WTX5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Skp1Q9WTX5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Skp1Q9WTX5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Skp1Q9WTX5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Skp1Q9WTX5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Skp1Q9WTX5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Skp1Q9WTX5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Skp1Q9WTX5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Skp1Q9WTX5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Skp1Q9WTX5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Skp1Q9WTX5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Skp1Q9WTX5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Skp1Q9WTX5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Skp1Q9WTX5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Skp1Q9WTX5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Skp1Q9WTX5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Skp1Q9WTX5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Skp1Q9WTX5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Skp1Q9WTX5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Skp1Q9WTX5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Skp1Q9WTX5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Skp1Q9WTX5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Skp1Q9WTX5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Skp1Q9WTX5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Skp1Q9WTX5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Skp1Q9WTX5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Skp1Q9WTX5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Skp1Q9WTX5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Skp1Q9WTX5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Skp1Q9WTX5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Skp1Q9WTX5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Skp1Q9WTX5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Skp1Q9WTX5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Skp1Q9WTX5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Skp1Q9WTX5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Skp1Q9WTX5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Skp1Q9WTX5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Skp1Q9WTX5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Skp1Q9WTX5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Skp1Q9WTX5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Skp1Q9WTX5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms