Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTP9

Vax2, Ventral anterior homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax2Q9WTP9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vax2Q9WTP9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vax2Q9WTP9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vax2Q9WTP9 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vax2Q9WTP9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vax2Q9WTP9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vax2Q9WTP9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vax2Q9WTP9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vax2Q9WTP9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vax2Q9WTP9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vax2Q9WTP9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vax2Q9WTP9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vax2Q9WTP9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Vax2Q9WTP9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vax2Q9WTP9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vax2Q9WTP9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vax2Q9WTP9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vax2Q9WTP9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vax2Q9WTP9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vax2Q9WTP9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vax2Q9WTP9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vax2Q9WTP9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vax2Q9WTP9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vax2Q9WTP9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vax2Q9WTP9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vax2Q9WTP9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vax2Q9WTP9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vax2Q9WTP9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vax2Q9WTP9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vax2Q9WTP9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vax2Q9WTP9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vax2Q9WTP9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vax2Q9WTP9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vax2Q9WTP9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vax2Q9WTP9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vax2Q9WTP9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vax2Q9WTP9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vax2Q9WTP9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vax2Q9WTP9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vax2Q9WTP9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vax2Q9WTP9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vax2Q9WTP9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vax2Q9WTP9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vax2Q9WTP9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vax2Q9WTP9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vax2Q9WTP9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vax2Q9WTP9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vax2Q9WTP9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vax2Q9WTP9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vax2Q9WTP9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vax2Q9WTP9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vax2Q9WTP9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vax2Q9WTP9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vax2Q9WTP9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vax2Q9WTP9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vax2Q9WTP9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vax2Q9WTP9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vax2Q9WTP9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vax2Q9WTP9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vax2Q9WTP9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vax2Q9WTP9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vax2Q9WTP9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vax2Q9WTP9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vax2Q9WTP9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vax2Q9WTP9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vax2Q9WTP9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vax2Q9WTP9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vax2Q9WTP9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vax2Q9WTP9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vax2Q9WTP9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vax2Q9WTP9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vax2Q9WTP9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vax2Q9WTP9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vax2Q9WTP9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vax2Q9WTP9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vax2Q9WTP9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vax2Q9WTP9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vax2Q9WTP9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vax2Q9WTP9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vax2Q9WTP9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vax2Q9WTP9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vax2Q9WTP9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vax2Q9WTP9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vax2Q9WTP9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vax2Q9WTP9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vax2Q9WTP9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vax2Q9WTP9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vax2Q9WTP9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vax2Q9WTP9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms