Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpc2Q9R244 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trpc2Q9R244 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trpc2Q9R244 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trpc2Q9R244 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trpc2Q9R244 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Trpc2Q9R244 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trpc2Q9R244 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trpc2Q9R244 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trpc2Q9R244 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trpc2Q9R244 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trpc2Q9R244 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trpc2Q9R244 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trpc2Q9R244 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trpc2Q9R244 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trpc2Q9R244 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trpc2Q9R244 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trpc2Q9R244 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trpc2Q9R244 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpc2Q9R244 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpc2Q9R244 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpc2Q9R244 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpc2Q9R244 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpc2Q9R244 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpc2Q9R244 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpc2Q9R244 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpc2Q9R244 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpc2Q9R244 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpc2Q9R244 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trpc2Q9R244 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trpc2Q9R244 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trpc2Q9R244 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trpc2Q9R244 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trpc2Q9R244 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trpc2Q9R244 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trpc2Q9R244 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trpc2Q9R244 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trpc2Q9R244 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trpc2Q9R244 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trpc2Q9R244 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trpc2Q9R244 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trpc2Q9R244 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trpc2Q9R244 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trpc2Q9R244 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trpc2Q9R244 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trpc2Q9R244 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trpc2Q9R244 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trpc2Q9R244 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Trpc2Q9R244 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Trpc2Q9R244 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trpc2Q9R244 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trpc2Q9R244 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trpc2Q9R244 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Trpc2Q9R244 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trpc2Q9R244 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trpc2Q9R244 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Trpc2Q9R244 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trpc2Q9R244 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trpc2Q9R244 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trpc2Q9R244 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trpc2Q9R244 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trpc2Q9R244 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trpc2Q9R244 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trpc2Q9R244 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trpc2Q9R244 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trpc2Q9R244 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trpc2Q9R244 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trpc2Q9R244 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trpc2Q9R244 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trpc2Q9R244 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trpc2Q9R244 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trpc2Q9R244 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trpc2Q9R244 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trpc2Q9R244 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trpc2Q9R244 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trpc2Q9R244 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trpc2Q9R244 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trpc2Q9R244 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trpc2Q9R244 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trpc2Q9R244 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trpc2Q9R244 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trpc2Q9R244 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trpc2Q9R244 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Trpc2Q9R244 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trpc2Q9R244 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Trpc2Q9R244 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trpc2Q9R244 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trpc2Q9R244 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trpc2Q9R244 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Trpc2Q9R244 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trpc2Q9R244 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trpc2Q9R244 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trpc2Q9R244 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trpc2Q9R244 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trpc2Q9R244 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trpc2Q9R244 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trpc2Q9R244 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trpc2Q9R244 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trpc2Q9R244 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trpc2Q9R244 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms