Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psma1Q9R1P4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psma1Q9R1P4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psma1Q9R1P4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Psma1Q9R1P4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psma1Q9R1P4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psma1Q9R1P4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psma1Q9R1P4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psma1Q9R1P4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psma1Q9R1P4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psma1Q9R1P4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psma1Q9R1P4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psma1Q9R1P4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psma1Q9R1P4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psma1Q9R1P4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psma1Q9R1P4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Psma1Q9R1P4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psma1Q9R1P4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psma1Q9R1P4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psma1Q9R1P4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psma1Q9R1P4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psma1Q9R1P4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psma1Q9R1P4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Psma1Q9R1P4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psma1Q9R1P4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psma1Q9R1P4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psma1Q9R1P4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psma1Q9R1P4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psma1Q9R1P4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psma1Q9R1P4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psma1Q9R1P4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psma1Q9R1P4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psma1Q9R1P4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psma1Q9R1P4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psma1Q9R1P4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psma1Q9R1P4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psma1Q9R1P4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psma1Q9R1P4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psma1Q9R1P4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psma1Q9R1P4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psma1Q9R1P4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psma1Q9R1P4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psma1Q9R1P4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma1Q9R1P4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma1Q9R1P4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma1Q9R1P4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma1Q9R1P4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma1Q9R1P4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma1Q9R1P4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma1Q9R1P4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma1Q9R1P4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma1Q9R1P4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma1Q9R1P4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma1Q9R1P4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma1Q9R1P4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psma1Q9R1P4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psma1Q9R1P4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psma1Q9R1P4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psma1Q9R1P4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psma1Q9R1P4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psma1Q9R1P4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psma1Q9R1P4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psma1Q9R1P4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psma1Q9R1P4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psma1Q9R1P4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psma1Q9R1P4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psma1Q9R1P4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psma1Q9R1P4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Psma1Q9R1P4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Psma1Q9R1P4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Psma1Q9R1P4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Psma1Q9R1P4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Psma1Q9R1P4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Psma1Q9R1P4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Psma1Q9R1P4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psma1Q9R1P4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psma1Q9R1P4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psma1Q9R1P4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psma1Q9R1P4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psma1Q9R1P4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psma1Q9R1P4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Psma1Q9R1P4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psma1Q9R1P4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psma1Q9R1P4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psma1Q9R1P4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psma1Q9R1P4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psma1Q9R1P4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psma1Q9R1P4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psma1Q9R1P4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psma1Q9R1P4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psma1Q9R1P4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psma1Q9R1P4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psma1Q9R1P4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psma1Q9R1P4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psma1Q9R1P4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psma1Q9R1P4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psma1Q9R1P4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psma1Q9R1P4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psma1Q9R1P4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psma1Q9R1P4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1718.1 ms