Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q9

Mpdu1, Mannose-P-dolichol utilization defect 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mpdu1Q9R0Q9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mpdu1Q9R0Q9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mpdu1Q9R0Q9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mpdu1Q9R0Q9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mpdu1Q9R0Q9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mpdu1Q9R0Q9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mpdu1Q9R0Q9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mpdu1Q9R0Q9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mpdu1Q9R0Q9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mpdu1Q9R0Q9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mpdu1Q9R0Q9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mpdu1Q9R0Q9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mpdu1Q9R0Q9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mpdu1Q9R0Q9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mpdu1Q9R0Q9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mpdu1Q9R0Q9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mpdu1Q9R0Q9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mpdu1Q9R0Q9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mpdu1Q9R0Q9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mpdu1Q9R0Q9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mpdu1Q9R0Q9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mpdu1Q9R0Q9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mpdu1Q9R0Q9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mpdu1Q9R0Q9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Mpdu1Q9R0Q9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mpdu1Q9R0Q9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mpdu1Q9R0Q9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mpdu1Q9R0Q9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mpdu1Q9R0Q9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mpdu1Q9R0Q9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mpdu1Q9R0Q9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mpdu1Q9R0Q9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mpdu1Q9R0Q9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mpdu1Q9R0Q9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mpdu1Q9R0Q9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mpdu1Q9R0Q9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mpdu1Q9R0Q9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mpdu1Q9R0Q9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mpdu1Q9R0Q9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Mpdu1Q9R0Q9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mpdu1Q9R0Q9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mpdu1Q9R0Q9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mpdu1Q9R0Q9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mpdu1Q9R0Q9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mpdu1Q9R0Q9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mpdu1Q9R0Q9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mpdu1Q9R0Q9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mpdu1Q9R0Q9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mpdu1Q9R0Q9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mpdu1Q9R0Q9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mpdu1Q9R0Q9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mpdu1Q9R0Q9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mpdu1Q9R0Q9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mpdu1Q9R0Q9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mpdu1Q9R0Q9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Mpdu1Q9R0Q9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mpdu1Q9R0Q9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mpdu1Q9R0Q9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Mpdu1Q9R0Q9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mpdu1Q9R0Q9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mpdu1Q9R0Q9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mpdu1Q9R0Q9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mpdu1Q9R0Q9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mpdu1Q9R0Q9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mpdu1Q9R0Q9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mpdu1Q9R0Q9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mpdu1Q9R0Q9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mpdu1Q9R0Q9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mpdu1Q9R0Q9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mpdu1Q9R0Q9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Mpdu1Q9R0Q9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mpdu1Q9R0Q9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mpdu1Q9R0Q9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mpdu1Q9R0Q9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mpdu1Q9R0Q9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mpdu1Q9R0Q9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mpdu1Q9R0Q9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mpdu1Q9R0Q9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mpdu1Q9R0Q9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mpdu1Q9R0Q9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mpdu1Q9R0Q9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mpdu1Q9R0Q9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mpdu1Q9R0Q9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mpdu1Q9R0Q9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mpdu1Q9R0Q9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mpdu1Q9R0Q9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mpdu1Q9R0Q9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mpdu1Q9R0Q9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mpdu1Q9R0Q9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mpdu1Q9R0Q9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mpdu1Q9R0Q9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mpdu1Q9R0Q9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mpdu1Q9R0Q9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mpdu1Q9R0Q9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mpdu1Q9R0Q9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mpdu1Q9R0Q9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mpdu1Q9R0Q9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mpdu1Q9R0Q9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mpdu1Q9R0Q9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mpdu1Q9R0Q9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms