Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tmed2Q9R0Q3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tmed2Q9R0Q3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tmed2Q9R0Q3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Tmed2Q9R0Q3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tmed2Q9R0Q3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tmed2Q9R0Q3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tmed2Q9R0Q3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tmed2Q9R0Q3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tmed2Q9R0Q3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tmed2Q9R0Q3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmed2Q9R0Q3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmed2Q9R0Q3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmed2Q9R0Q3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmed2Q9R0Q3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmed2Q9R0Q3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmed2Q9R0Q3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmed2Q9R0Q3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmed2Q9R0Q3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmed2Q9R0Q3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmed2Q9R0Q3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmed2Q9R0Q3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmed2Q9R0Q3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tmed2Q9R0Q3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tmed2Q9R0Q3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tmed2Q9R0Q3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tmed2Q9R0Q3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tmed2Q9R0Q3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tmed2Q9R0Q3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tmed2Q9R0Q3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tmed2Q9R0Q3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tmed2Q9R0Q3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tmed2Q9R0Q3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tmed2Q9R0Q3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tmed2Q9R0Q3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tmed2Q9R0Q3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tmed2Q9R0Q3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tmed2Q9R0Q3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tmed2Q9R0Q3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tmed2Q9R0Q3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tmed2Q9R0Q3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tmed2Q9R0Q3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tmed2Q9R0Q3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tmed2Q9R0Q3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tmed2Q9R0Q3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tmed2Q9R0Q3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tmed2Q9R0Q3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tmed2Q9R0Q3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tmed2Q9R0Q3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tmed2Q9R0Q3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tmed2Q9R0Q3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Tmed2Q9R0Q3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tmed2Q9R0Q3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tmed2Q9R0Q3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tmed2Q9R0Q3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tmed2Q9R0Q3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tmed2Q9R0Q3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tmed2Q9R0Q3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tmed2Q9R0Q3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tmed2Q9R0Q3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tmed2Q9R0Q3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tmed2Q9R0Q3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tmed2Q9R0Q3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tmed2Q9R0Q3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tmed2Q9R0Q3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tmed2Q9R0Q3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tmed2Q9R0Q3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tmed2Q9R0Q3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tmed2Q9R0Q3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tmed2Q9R0Q3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tmed2Q9R0Q3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tmed2Q9R0Q3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tmed2Q9R0Q3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tmed2Q9R0Q3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tmed2Q9R0Q3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tmed2Q9R0Q3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Tmed2Q9R0Q3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tmed2Q9R0Q3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tmed2Q9R0Q3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tmed2Q9R0Q3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tmed2Q9R0Q3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tmed2Q9R0Q3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tmed2Q9R0Q3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tmed2Q9R0Q3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tmed2Q9R0Q3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tmed2Q9R0Q3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tmed2Q9R0Q3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tmed2Q9R0Q3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Tmed2Q9R0Q3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tmed2Q9R0Q3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tmed2Q9R0Q3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tmed2Q9R0Q3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tmed2Q9R0Q3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmed2Q9R0Q3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmed2Q9R0Q3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmed2Q9R0Q3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmed2Q9R0Q3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmed2Q9R0Q3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmed2Q9R0Q3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmed2Q9R0Q3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms