Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Lamc3Q9R0B6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Lamc3Q9R0B6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Lamc3Q9R0B6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Lamc3Q9R0B6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Lamc3Q9R0B6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Lamc3Q9R0B6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Lamc3Q9R0B6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Lamc3Q9R0B6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
Lamc3Q9R0B6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Lamc3Q9R0B6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Lamc3Q9R0B6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Lamc3Q9R0B6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Lamc3Q9R0B6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Lamc3Q9R0B6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Lamc3Q9R0B6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Lamc3Q9R0B6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Lamc3Q9R0B6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Lamc3Q9R0B6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Lamc3Q9R0B6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Lamc3Q9R0B6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Lamc3Q9R0B6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Lamc3Q9R0B6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Lamc3Q9R0B6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Lamc3Q9R0B6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Lamc3Q9R0B6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Lamc3Q9R0B6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Lamc3Q9R0B6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Lamc3Q9R0B6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Lamc3Q9R0B6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Lamc3Q9R0B6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Lamc3Q9R0B6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Lamc3Q9R0B6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Lamc3Q9R0B6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Lamc3Q9R0B6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Lamc3Q9R0B6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Lamc3Q9R0B6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Lamc3Q9R0B6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Lamc3Q9R0B6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Lamc3Q9R0B6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Lamc3Q9R0B6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Lamc3Q9R0B6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Lamc3Q9R0B6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Lamc3Q9R0B6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Lamc3Q9R0B6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Lamc3Q9R0B6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
Lamc3Q9R0B6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Lamc3Q9R0B6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Lamc3Q9R0B6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Lamc3Q9R0B6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Lamc3Q9R0B6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Lamc3Q9R0B6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
Lamc3Q9R0B6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Lamc3Q9R0B6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Lamc3Q9R0B6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Lamc3Q9R0B6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Lamc3Q9R0B6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Lamc3Q9R0B6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Lamc3Q9R0B6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Lamc3Q9R0B6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Lamc3Q9R0B6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
Lamc3Q9R0B6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Lamc3Q9R0B6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Lamc3Q9R0B6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Lamc3Q9R0B6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Lamc3Q9R0B6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Lamc3Q9R0B6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Lamc3Q9R0B6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Lamc3Q9R0B6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
Lamc3Q9R0B6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Lamc3Q9R0B6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Lamc3Q9R0B6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Lamc3Q9R0B6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Lamc3Q9R0B6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Lamc3Q9R0B6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Lamc3Q9R0B6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Lamc3Q9R0B6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Lamc3Q9R0B6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Lamc3Q9R0B6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Lamc3Q9R0B6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Lamc3Q9R0B6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Lamc3Q9R0B6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Lamc3Q9R0B6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Lamc3Q9R0B6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
Lamc3Q9R0B6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Lamc3Q9R0B6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Lamc3Q9R0B6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Lamc3Q9R0B6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Lamc3Q9R0B6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
Lamc3Q9R0B6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Lamc3Q9R0B6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Lamc3Q9R0B6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Lamc3Q9R0B6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Lamc3Q9R0B6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Lamc3Q9R0B6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Lamc3Q9R0B6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Lamc3Q9R0B6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
Lamc3Q9R0B6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Lamc3Q9R0B6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Lamc3Q9R0B6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms