Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rnf4Q9QZS2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rnf4Q9QZS2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rnf4Q9QZS2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf4Q9QZS2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf4Q9QZS2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf4Q9QZS2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf4Q9QZS2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf4Q9QZS2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf4Q9QZS2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf4Q9QZS2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf4Q9QZS2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf4Q9QZS2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf4Q9QZS2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf4Q9QZS2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf4Q9QZS2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf4Q9QZS2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf4Q9QZS2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf4Q9QZS2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf4Q9QZS2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf4Q9QZS2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf4Q9QZS2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf4Q9QZS2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf4Q9QZS2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf4Q9QZS2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf4Q9QZS2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf4Q9QZS2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf4Q9QZS2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf4Q9QZS2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf4Q9QZS2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf4Q9QZS2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf4Q9QZS2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf4Q9QZS2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf4Q9QZS2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf4Q9QZS2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf4Q9QZS2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf4Q9QZS2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf4Q9QZS2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf4Q9QZS2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf4Q9QZS2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf4Q9QZS2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf4Q9QZS2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf4Q9QZS2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf4Q9QZS2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf4Q9QZS2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf4Q9QZS2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf4Q9QZS2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf4Q9QZS2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf4Q9QZS2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf4Q9QZS2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf4Q9QZS2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf4Q9QZS2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf4Q9QZS2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf4Q9QZS2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf4Q9QZS2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Rnf4Q9QZS2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Rnf4Q9QZS2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnf4Q9QZS2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnf4Q9QZS2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnf4Q9QZS2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnf4Q9QZS2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnf4Q9QZS2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnf4Q9QZS2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf4Q9QZS2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf4Q9QZS2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf4Q9QZS2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf4Q9QZS2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf4Q9QZS2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf4Q9QZS2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf4Q9QZS2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf4Q9QZS2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf4Q9QZS2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf4Q9QZS2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf4Q9QZS2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf4Q9QZS2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf4Q9QZS2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf4Q9QZS2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf4Q9QZS2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf4Q9QZS2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf4Q9QZS2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf4Q9QZS2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf4Q9QZS2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf4Q9QZS2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf4Q9QZS2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf4Q9QZS2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf4Q9QZS2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf4Q9QZS2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf4Q9QZS2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf4Q9QZS2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf4Q9QZS2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf4Q9QZS2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf4Q9QZS2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf4Q9QZS2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf4Q9QZS2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf4Q9QZS2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf4Q9QZS2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnf4Q9QZS2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnf4Q9QZS2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnf4Q9QZS2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnf4Q9QZS2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms