Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ8

H2afy, Core histone macro-H2A.1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afyQ9QZQ8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2afyQ9QZQ8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2afyQ9QZQ8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2afyQ9QZQ8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2afyQ9QZQ8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2afyQ9QZQ8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2afyQ9QZQ8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2afyQ9QZQ8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2afyQ9QZQ8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2afyQ9QZQ8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2afyQ9QZQ8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2afyQ9QZQ8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2afyQ9QZQ8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2afyQ9QZQ8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2afyQ9QZQ8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2afyQ9QZQ8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2afyQ9QZQ8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2afyQ9QZQ8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2afyQ9QZQ8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2afyQ9QZQ8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2afyQ9QZQ8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2afyQ9QZQ8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2afyQ9QZQ8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2afyQ9QZQ8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2afyQ9QZQ8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2afyQ9QZQ8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2afyQ9QZQ8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2afyQ9QZQ8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2afyQ9QZQ8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2afyQ9QZQ8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2afyQ9QZQ8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2afyQ9QZQ8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2afyQ9QZQ8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2afyQ9QZQ8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2afyQ9QZQ8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2afyQ9QZQ8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
H2afyQ9QZQ8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2afyQ9QZQ8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2afyQ9QZQ8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2afyQ9QZQ8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
H2afyQ9QZQ8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2afyQ9QZQ8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
H2afyQ9QZQ8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2afyQ9QZQ8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2afyQ9QZQ8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2afyQ9QZQ8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2afyQ9QZQ8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2afyQ9QZQ8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2afyQ9QZQ8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2afyQ9QZQ8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2afyQ9QZQ8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2afyQ9QZQ8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2afyQ9QZQ8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2afyQ9QZQ8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2afyQ9QZQ8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2afyQ9QZQ8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2afyQ9QZQ8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2afyQ9QZQ8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2afyQ9QZQ8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2afyQ9QZQ8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2afyQ9QZQ8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2afyQ9QZQ8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2afyQ9QZQ8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2afyQ9QZQ8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2afyQ9QZQ8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2afyQ9QZQ8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2afyQ9QZQ8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2afyQ9QZQ8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2afyQ9QZQ8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2afyQ9QZQ8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2afyQ9QZQ8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2afyQ9QZQ8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2afyQ9QZQ8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2afyQ9QZQ8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2afyQ9QZQ8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2afyQ9QZQ8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2afyQ9QZQ8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2afyQ9QZQ8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2afyQ9QZQ8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2afyQ9QZQ8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2afyQ9QZQ8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2afyQ9QZQ8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2afyQ9QZQ8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2afyQ9QZQ8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2afyQ9QZQ8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2afyQ9QZQ8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2afyQ9QZQ8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2afyQ9QZQ8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2afyQ9QZQ8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2afyQ9QZQ8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2afyQ9QZQ8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2afyQ9QZQ8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2afyQ9QZQ8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2afyQ9QZQ8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2afyQ9QZQ8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2afyQ9QZQ8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2afyQ9QZQ8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2afyQ9QZQ8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2afyQ9QZQ8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
H2afyQ9QZQ8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms