Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ25

Vnn3, Vascular non-inflammatory molecule 3, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vnn3Q9QZ25 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vnn3Q9QZ25 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vnn3Q9QZ25 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vnn3Q9QZ25 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vnn3Q9QZ25 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vnn3Q9QZ25 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vnn3Q9QZ25 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vnn3Q9QZ25 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vnn3Q9QZ25 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vnn3Q9QZ25 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vnn3Q9QZ25 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vnn3Q9QZ25 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vnn3Q9QZ25 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vnn3Q9QZ25 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vnn3Q9QZ25 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vnn3Q9QZ25 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vnn3Q9QZ25 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vnn3Q9QZ25 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vnn3Q9QZ25 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vnn3Q9QZ25 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Vnn3Q9QZ25 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vnn3Q9QZ25 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vnn3Q9QZ25 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vnn3Q9QZ25 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vnn3Q9QZ25 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vnn3Q9QZ25 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vnn3Q9QZ25 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vnn3Q9QZ25 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vnn3Q9QZ25 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vnn3Q9QZ25 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vnn3Q9QZ25 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Vnn3Q9QZ25 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Vnn3Q9QZ25 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vnn3Q9QZ25 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vnn3Q9QZ25 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Vnn3Q9QZ25 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vnn3Q9QZ25 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vnn3Q9QZ25 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vnn3Q9QZ25 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vnn3Q9QZ25 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vnn3Q9QZ25 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vnn3Q9QZ25 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vnn3Q9QZ25 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vnn3Q9QZ25 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vnn3Q9QZ25 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vnn3Q9QZ25 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vnn3Q9QZ25 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vnn3Q9QZ25 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vnn3Q9QZ25 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vnn3Q9QZ25 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vnn3Q9QZ25 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vnn3Q9QZ25 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vnn3Q9QZ25 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vnn3Q9QZ25 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Vnn3Q9QZ25 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vnn3Q9QZ25 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vnn3Q9QZ25 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vnn3Q9QZ25 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vnn3Q9QZ25 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Vnn3Q9QZ25 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vnn3Q9QZ25 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vnn3Q9QZ25 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vnn3Q9QZ25 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vnn3Q9QZ25 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vnn3Q9QZ25 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vnn3Q9QZ25 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vnn3Q9QZ25 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vnn3Q9QZ25 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vnn3Q9QZ25 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vnn3Q9QZ25 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vnn3Q9QZ25 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vnn3Q9QZ25 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vnn3Q9QZ25 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vnn3Q9QZ25 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vnn3Q9QZ25 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vnn3Q9QZ25 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vnn3Q9QZ25 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vnn3Q9QZ25 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vnn3Q9QZ25 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vnn3Q9QZ25 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vnn3Q9QZ25 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vnn3Q9QZ25 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vnn3Q9QZ25 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vnn3Q9QZ25 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vnn3Q9QZ25 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vnn3Q9QZ25 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vnn3Q9QZ25 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vnn3Q9QZ25 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vnn3Q9QZ25 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vnn3Q9QZ25 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vnn3Q9QZ25 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vnn3Q9QZ25 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vnn3Q9QZ25 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vnn3Q9QZ25 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vnn3Q9QZ25 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vnn3Q9QZ25 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Vnn3Q9QZ25 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vnn3Q9QZ25 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vnn3Q9QZ25 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vnn3Q9QZ25 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms