Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYR6

Map1a, Microtubule-associated protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 2,776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map1aQ9QYR6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Map1aQ9QYR6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Map1aQ9QYR6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Map1aQ9QYR6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Map1aQ9QYR6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Map1aQ9QYR6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Map1aQ9QYR6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Map1aQ9QYR6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Map1aQ9QYR6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Map1aQ9QYR6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Map1aQ9QYR6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Map1aQ9QYR6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Map1aQ9QYR6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Map1aQ9QYR6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Map1aQ9QYR6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Map1aQ9QYR6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Map1aQ9QYR6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Map1aQ9QYR6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Map1aQ9QYR6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Map1aQ9QYR6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Map1aQ9QYR6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Map1aQ9QYR6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Map1aQ9QYR6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Map1aQ9QYR6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Map1aQ9QYR6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Map1aQ9QYR6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Map1aQ9QYR6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Map1aQ9QYR6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Map1aQ9QYR6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Map1aQ9QYR6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Map1aQ9QYR6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Map1aQ9QYR6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Map1aQ9QYR6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Map1aQ9QYR6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Map1aQ9QYR6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Map1aQ9QYR6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Map1aQ9QYR6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Map1aQ9QYR6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Map1aQ9QYR6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Map1aQ9QYR6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Map1aQ9QYR6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Map1aQ9QYR6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Map1aQ9QYR6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Map1aQ9QYR6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Map1aQ9QYR6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Map1aQ9QYR6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Map1aQ9QYR6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Map1aQ9QYR6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Map1aQ9QYR6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Map1aQ9QYR6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Map1aQ9QYR6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Map1aQ9QYR6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Map1aQ9QYR6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Map1aQ9QYR6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Map1aQ9QYR6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Map1aQ9QYR6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Map1aQ9QYR6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Map1aQ9QYR6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Map1aQ9QYR6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Map1aQ9QYR6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Map1aQ9QYR6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Map1aQ9QYR6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Map1aQ9QYR6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Map1aQ9QYR6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Map1aQ9QYR6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Map1aQ9QYR6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Map1aQ9QYR6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Map1aQ9QYR6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Map1aQ9QYR6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Map1aQ9QYR6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Map1aQ9QYR6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Map1aQ9QYR6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Map1aQ9QYR6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Map1aQ9QYR6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Map1aQ9QYR6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Map1aQ9QYR6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Map1aQ9QYR6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Map1aQ9QYR6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Map1aQ9QYR6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Map1aQ9QYR6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Map1aQ9QYR6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Map1aQ9QYR6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Map1aQ9QYR6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Map1aQ9QYR6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Map1aQ9QYR6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Map1aQ9QYR6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Map1aQ9QYR6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Map1aQ9QYR6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Map1aQ9QYR6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Map1aQ9QYR6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Map1aQ9QYR6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Map1aQ9QYR6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Map1aQ9QYR6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Map1aQ9QYR6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Map1aQ9QYR6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Map1aQ9QYR6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Map1aQ9QYR6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Map1aQ9QYR6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Map1aQ9QYR6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Map1aQ9QYR6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms