Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pcsk1nQ9QXV0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pcsk1nQ9QXV0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pcsk1nQ9QXV0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pcsk1nQ9QXV0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pcsk1nQ9QXV0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pcsk1nQ9QXV0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pcsk1nQ9QXV0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pcsk1nQ9QXV0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Pcsk1nQ9QXV0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Pcsk1nQ9QXV0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pcsk1nQ9QXV0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pcsk1nQ9QXV0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pcsk1nQ9QXV0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pcsk1nQ9QXV0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pcsk1nQ9QXV0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pcsk1nQ9QXV0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pcsk1nQ9QXV0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pcsk1nQ9QXV0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pcsk1nQ9QXV0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pcsk1nQ9QXV0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pcsk1nQ9QXV0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pcsk1nQ9QXV0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Pcsk1nQ9QXV0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pcsk1nQ9QXV0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pcsk1nQ9QXV0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pcsk1nQ9QXV0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pcsk1nQ9QXV0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pcsk1nQ9QXV0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pcsk1nQ9QXV0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Pcsk1nQ9QXV0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pcsk1nQ9QXV0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pcsk1nQ9QXV0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pcsk1nQ9QXV0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pcsk1nQ9QXV0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pcsk1nQ9QXV0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pcsk1nQ9QXV0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pcsk1nQ9QXV0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pcsk1nQ9QXV0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pcsk1nQ9QXV0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pcsk1nQ9QXV0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pcsk1nQ9QXV0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pcsk1nQ9QXV0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pcsk1nQ9QXV0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pcsk1nQ9QXV0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pcsk1nQ9QXV0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcsk1nQ9QXV0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcsk1nQ9QXV0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcsk1nQ9QXV0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcsk1nQ9QXV0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcsk1nQ9QXV0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcsk1nQ9QXV0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcsk1nQ9QXV0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcsk1nQ9QXV0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcsk1nQ9QXV0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcsk1nQ9QXV0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcsk1nQ9QXV0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcsk1nQ9QXV0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcsk1nQ9QXV0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcsk1nQ9QXV0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pcsk1nQ9QXV0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pcsk1nQ9QXV0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pcsk1nQ9QXV0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pcsk1nQ9QXV0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pcsk1nQ9QXV0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pcsk1nQ9QXV0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pcsk1nQ9QXV0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pcsk1nQ9QXV0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pcsk1nQ9QXV0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pcsk1nQ9QXV0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pcsk1nQ9QXV0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pcsk1nQ9QXV0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pcsk1nQ9QXV0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pcsk1nQ9QXV0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pcsk1nQ9QXV0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pcsk1nQ9QXV0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pcsk1nQ9QXV0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pcsk1nQ9QXV0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pcsk1nQ9QXV0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pcsk1nQ9QXV0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pcsk1nQ9QXV0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pcsk1nQ9QXV0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pcsk1nQ9QXV0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pcsk1nQ9QXV0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pcsk1nQ9QXV0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pcsk1nQ9QXV0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pcsk1nQ9QXV0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pcsk1nQ9QXV0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pcsk1nQ9QXV0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pcsk1nQ9QXV0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pcsk1nQ9QXV0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pcsk1nQ9QXV0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pcsk1nQ9QXV0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pcsk1nQ9QXV0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pcsk1nQ9QXV0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pcsk1nQ9QXV0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pcsk1nQ9QXV0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pcsk1nQ9QXV0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms