Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK3

Copg2, Coatomer subunit gamma-2, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg2Q9QXK3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Copg2Q9QXK3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Copg2Q9QXK3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Copg2Q9QXK3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Copg2Q9QXK3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Copg2Q9QXK3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Copg2Q9QXK3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Copg2Q9QXK3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Copg2Q9QXK3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Copg2Q9QXK3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Copg2Q9QXK3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Copg2Q9QXK3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Copg2Q9QXK3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Copg2Q9QXK3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Copg2Q9QXK3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Copg2Q9QXK3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Copg2Q9QXK3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Copg2Q9QXK3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Copg2Q9QXK3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Copg2Q9QXK3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Copg2Q9QXK3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Copg2Q9QXK3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Copg2Q9QXK3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Copg2Q9QXK3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Copg2Q9QXK3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Copg2Q9QXK3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Copg2Q9QXK3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Copg2Q9QXK3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Copg2Q9QXK3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Copg2Q9QXK3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Copg2Q9QXK3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Copg2Q9QXK3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Copg2Q9QXK3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Copg2Q9QXK3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Copg2Q9QXK3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Copg2Q9QXK3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Copg2Q9QXK3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Copg2Q9QXK3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Copg2Q9QXK3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Copg2Q9QXK3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Copg2Q9QXK3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Copg2Q9QXK3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Copg2Q9QXK3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Copg2Q9QXK3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Copg2Q9QXK3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Copg2Q9QXK3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Copg2Q9QXK3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Copg2Q9QXK3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Copg2Q9QXK3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Copg2Q9QXK3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Copg2Q9QXK3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Copg2Q9QXK3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Copg2Q9QXK3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Copg2Q9QXK3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Copg2Q9QXK3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Copg2Q9QXK3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Copg2Q9QXK3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Copg2Q9QXK3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Copg2Q9QXK3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Copg2Q9QXK3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Copg2Q9QXK3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Copg2Q9QXK3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Copg2Q9QXK3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Copg2Q9QXK3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Copg2Q9QXK3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Copg2Q9QXK3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Copg2Q9QXK3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Copg2Q9QXK3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Copg2Q9QXK3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Copg2Q9QXK3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Copg2Q9QXK3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Copg2Q9QXK3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Copg2Q9QXK3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Copg2Q9QXK3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Copg2Q9QXK3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Copg2Q9QXK3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Copg2Q9QXK3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Copg2Q9QXK3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Copg2Q9QXK3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Copg2Q9QXK3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Copg2Q9QXK3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Copg2Q9QXK3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Copg2Q9QXK3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Copg2Q9QXK3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Copg2Q9QXK3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Copg2Q9QXK3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Copg2Q9QXK3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Copg2Q9QXK3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Copg2Q9QXK3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Copg2Q9QXK3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Copg2Q9QXK3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Copg2Q9QXK3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Copg2Q9QXK3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Copg2Q9QXK3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Copg2Q9QXK3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Copg2Q9QXK3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Copg2Q9QXK3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Copg2Q9QXK3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Copg2Q9QXK3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Copg2Q9QXK3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms