Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWF0

Chaf1a, Chromatin assembly factor 1 subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1aQ9QWF0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Chaf1aQ9QWF0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chaf1aQ9QWF0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chaf1aQ9QWF0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chaf1aQ9QWF0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chaf1aQ9QWF0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chaf1aQ9QWF0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chaf1aQ9QWF0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chaf1aQ9QWF0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chaf1aQ9QWF0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chaf1aQ9QWF0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chaf1aQ9QWF0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chaf1aQ9QWF0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Chaf1aQ9QWF0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Chaf1aQ9QWF0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chaf1aQ9QWF0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chaf1aQ9QWF0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chaf1aQ9QWF0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chaf1aQ9QWF0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chaf1aQ9QWF0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chaf1aQ9QWF0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chaf1aQ9QWF0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chaf1aQ9QWF0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chaf1aQ9QWF0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chaf1aQ9QWF0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chaf1aQ9QWF0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chaf1aQ9QWF0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chaf1aQ9QWF0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chaf1aQ9QWF0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chaf1aQ9QWF0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chaf1aQ9QWF0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chaf1aQ9QWF0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chaf1aQ9QWF0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chaf1aQ9QWF0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chaf1aQ9QWF0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chaf1aQ9QWF0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chaf1aQ9QWF0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chaf1aQ9QWF0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chaf1aQ9QWF0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chaf1aQ9QWF0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chaf1aQ9QWF0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chaf1aQ9QWF0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chaf1aQ9QWF0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chaf1aQ9QWF0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chaf1aQ9QWF0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chaf1aQ9QWF0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chaf1aQ9QWF0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chaf1aQ9QWF0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chaf1aQ9QWF0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chaf1aQ9QWF0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chaf1aQ9QWF0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chaf1aQ9QWF0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chaf1aQ9QWF0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chaf1aQ9QWF0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chaf1aQ9QWF0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chaf1aQ9QWF0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chaf1aQ9QWF0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chaf1aQ9QWF0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chaf1aQ9QWF0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chaf1aQ9QWF0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chaf1aQ9QWF0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chaf1aQ9QWF0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chaf1aQ9QWF0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chaf1aQ9QWF0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chaf1aQ9QWF0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chaf1aQ9QWF0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chaf1aQ9QWF0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chaf1aQ9QWF0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chaf1aQ9QWF0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chaf1aQ9QWF0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chaf1aQ9QWF0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chaf1aQ9QWF0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chaf1aQ9QWF0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chaf1aQ9QWF0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chaf1aQ9QWF0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chaf1aQ9QWF0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chaf1aQ9QWF0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chaf1aQ9QWF0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chaf1aQ9QWF0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chaf1aQ9QWF0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chaf1aQ9QWF0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Chaf1aQ9QWF0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Chaf1aQ9QWF0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chaf1aQ9QWF0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chaf1aQ9QWF0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chaf1aQ9QWF0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chaf1aQ9QWF0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chaf1aQ9QWF0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chaf1aQ9QWF0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chaf1aQ9QWF0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chaf1aQ9QWF0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chaf1aQ9QWF0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chaf1aQ9QWF0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chaf1aQ9QWF0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chaf1aQ9QWF0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chaf1aQ9QWF0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chaf1aQ9QWF0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chaf1aQ9QWF0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chaf1aQ9QWF0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chaf1aQ9QWF0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms