Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PdcQ9QW08 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PdcQ9QW08 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PdcQ9QW08 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PdcQ9QW08 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PdcQ9QW08 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PdcQ9QW08 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PdcQ9QW08 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PdcQ9QW08 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PdcQ9QW08 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PdcQ9QW08 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PdcQ9QW08 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PdcQ9QW08 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PdcQ9QW08 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PdcQ9QW08 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PdcQ9QW08 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PdcQ9QW08 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PdcQ9QW08 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PdcQ9QW08 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PdcQ9QW08 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PdcQ9QW08 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PdcQ9QW08 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PdcQ9QW08 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PdcQ9QW08 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PdcQ9QW08 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PdcQ9QW08 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PdcQ9QW08 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PdcQ9QW08 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PdcQ9QW08 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PdcQ9QW08 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PdcQ9QW08 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PdcQ9QW08 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PdcQ9QW08 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PdcQ9QW08 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PdcQ9QW08 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PdcQ9QW08 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PdcQ9QW08 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PdcQ9QW08 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PdcQ9QW08 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PdcQ9QW08 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PdcQ9QW08 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PdcQ9QW08 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PdcQ9QW08 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PdcQ9QW08 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PdcQ9QW08 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PdcQ9QW08 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PdcQ9QW08 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PdcQ9QW08 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PdcQ9QW08 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PdcQ9QW08 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PdcQ9QW08 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PdcQ9QW08 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PdcQ9QW08 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PdcQ9QW08 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PdcQ9QW08 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PdcQ9QW08 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PdcQ9QW08 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PdcQ9QW08 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PdcQ9QW08 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PdcQ9QW08 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PdcQ9QW08 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PdcQ9QW08 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PdcQ9QW08 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PdcQ9QW08 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PdcQ9QW08 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PdcQ9QW08 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PdcQ9QW08 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PdcQ9QW08 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PdcQ9QW08 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PdcQ9QW08 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PdcQ9QW08 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PdcQ9QW08 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PdcQ9QW08 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PdcQ9QW08 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PdcQ9QW08 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PdcQ9QW08 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PdcQ9QW08 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PdcQ9QW08 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PdcQ9QW08 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PdcQ9QW08 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PdcQ9QW08 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PdcQ9QW08 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PdcQ9QW08 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PdcQ9QW08 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PdcQ9QW08 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PdcQ9QW08 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PdcQ9QW08 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PdcQ9QW08 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PdcQ9QW08 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PdcQ9QW08 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PdcQ9QW08 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PdcQ9QW08 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PdcQ9QW08 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PdcQ9QW08 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PdcQ9QW08 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PdcQ9QW08 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PdcQ9QW08 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PdcQ9QW08 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PdcQ9QW08 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PdcQ9QW08 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms