Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rai2Q9QVY8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rai2Q9QVY8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rai2Q9QVY8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rai2Q9QVY8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rai2Q9QVY8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Rai2Q9QVY8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rai2Q9QVY8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rai2Q9QVY8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rai2Q9QVY8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rai2Q9QVY8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Rai2Q9QVY8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Rai2Q9QVY8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rai2Q9QVY8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rai2Q9QVY8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rai2Q9QVY8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Rai2Q9QVY8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rai2Q9QVY8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rai2Q9QVY8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rai2Q9QVY8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rai2Q9QVY8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rai2Q9QVY8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Rai2Q9QVY8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rai2Q9QVY8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rai2Q9QVY8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rai2Q9QVY8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rai2Q9QVY8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rai2Q9QVY8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rai2Q9QVY8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rai2Q9QVY8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rai2Q9QVY8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rai2Q9QVY8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rai2Q9QVY8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rai2Q9QVY8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rai2Q9QVY8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rai2Q9QVY8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rai2Q9QVY8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rai2Q9QVY8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rai2Q9QVY8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rai2Q9QVY8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rai2Q9QVY8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rai2Q9QVY8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rai2Q9QVY8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rai2Q9QVY8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rai2Q9QVY8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rai2Q9QVY8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rai2Q9QVY8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rai2Q9QVY8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rai2Q9QVY8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rai2Q9QVY8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rai2Q9QVY8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rai2Q9QVY8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rai2Q9QVY8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rai2Q9QVY8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rai2Q9QVY8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rai2Q9QVY8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rai2Q9QVY8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rai2Q9QVY8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rai2Q9QVY8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rai2Q9QVY8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rai2Q9QVY8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rai2Q9QVY8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rai2Q9QVY8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rai2Q9QVY8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rai2Q9QVY8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rai2Q9QVY8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rai2Q9QVY8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rai2Q9QVY8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Rai2Q9QVY8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rai2Q9QVY8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rai2Q9QVY8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rai2Q9QVY8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rai2Q9QVY8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rai2Q9QVY8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rai2Q9QVY8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rai2Q9QVY8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rai2Q9QVY8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rai2Q9QVY8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rai2Q9QVY8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rai2Q9QVY8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rai2Q9QVY8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rai2Q9QVY8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rai2Q9QVY8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rai2Q9QVY8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rai2Q9QVY8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rai2Q9QVY8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rai2Q9QVY8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rai2Q9QVY8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Rai2Q9QVY8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Rai2Q9QVY8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Rai2Q9QVY8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rai2Q9QVY8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rai2Q9QVY8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rai2Q9QVY8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rai2Q9QVY8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Rai2Q9QVY8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rai2Q9QVY8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rai2Q9QVY8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rai2Q9QVY8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rai2Q9QVY8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms