Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM9

Psma6, Proteasome subunit alpha type-6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma6Q9QUM9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psma6Q9QUM9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Psma6Q9QUM9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psma6Q9QUM9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psma6Q9QUM9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psma6Q9QUM9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psma6Q9QUM9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psma6Q9QUM9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psma6Q9QUM9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psma6Q9QUM9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psma6Q9QUM9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psma6Q9QUM9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psma6Q9QUM9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psma6Q9QUM9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psma6Q9QUM9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psma6Q9QUM9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psma6Q9QUM9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psma6Q9QUM9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psma6Q9QUM9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psma6Q9QUM9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psma6Q9QUM9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psma6Q9QUM9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psma6Q9QUM9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psma6Q9QUM9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psma6Q9QUM9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psma6Q9QUM9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psma6Q9QUM9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psma6Q9QUM9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psma6Q9QUM9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psma6Q9QUM9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psma6Q9QUM9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psma6Q9QUM9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psma6Q9QUM9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psma6Q9QUM9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psma6Q9QUM9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psma6Q9QUM9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psma6Q9QUM9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psma6Q9QUM9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psma6Q9QUM9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psma6Q9QUM9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psma6Q9QUM9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psma6Q9QUM9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psma6Q9QUM9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psma6Q9QUM9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psma6Q9QUM9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psma6Q9QUM9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psma6Q9QUM9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psma6Q9QUM9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psma6Q9QUM9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psma6Q9QUM9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psma6Q9QUM9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psma6Q9QUM9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psma6Q9QUM9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psma6Q9QUM9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psma6Q9QUM9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psma6Q9QUM9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psma6Q9QUM9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psma6Q9QUM9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psma6Q9QUM9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psma6Q9QUM9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psma6Q9QUM9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psma6Q9QUM9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Psma6Q9QUM9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Psma6Q9QUM9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Psma6Q9QUM9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Psma6Q9QUM9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psma6Q9QUM9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psma6Q9QUM9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psma6Q9QUM9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psma6Q9QUM9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psma6Q9QUM9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psma6Q9QUM9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psma6Q9QUM9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psma6Q9QUM9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psma6Q9QUM9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psma6Q9QUM9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psma6Q9QUM9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psma6Q9QUM9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psma6Q9QUM9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psma6Q9QUM9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psma6Q9QUM9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psma6Q9QUM9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psma6Q9QUM9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psma6Q9QUM9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psma6Q9QUM9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psma6Q9QUM9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psma6Q9QUM9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psma6Q9QUM9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psma6Q9QUM9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psma6Q9QUM9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psma6Q9QUM9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psma6Q9QUM9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psma6Q9QUM9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psma6Q9QUM9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psma6Q9QUM9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Psma6Q9QUM9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psma6Q9QUM9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psma6Q9QUM9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psma6Q9QUM9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psma6Q9QUM9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms