Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cln8Q9QUK3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cln8Q9QUK3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cln8Q9QUK3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cln8Q9QUK3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cln8Q9QUK3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cln8Q9QUK3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cln8Q9QUK3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cln8Q9QUK3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cln8Q9QUK3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cln8Q9QUK3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cln8Q9QUK3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cln8Q9QUK3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cln8Q9QUK3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cln8Q9QUK3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cln8Q9QUK3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cln8Q9QUK3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cln8Q9QUK3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cln8Q9QUK3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cln8Q9QUK3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cln8Q9QUK3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cln8Q9QUK3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cln8Q9QUK3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cln8Q9QUK3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cln8Q9QUK3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cln8Q9QUK3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cln8Q9QUK3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cln8Q9QUK3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cln8Q9QUK3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cln8Q9QUK3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cln8Q9QUK3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cln8Q9QUK3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cln8Q9QUK3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cln8Q9QUK3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cln8Q9QUK3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cln8Q9QUK3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cln8Q9QUK3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cln8Q9QUK3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cln8Q9QUK3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cln8Q9QUK3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cln8Q9QUK3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cln8Q9QUK3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cln8Q9QUK3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cln8Q9QUK3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cln8Q9QUK3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cln8Q9QUK3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cln8Q9QUK3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cln8Q9QUK3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cln8Q9QUK3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cln8Q9QUK3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cln8Q9QUK3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cln8Q9QUK3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cln8Q9QUK3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cln8Q9QUK3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cln8Q9QUK3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cln8Q9QUK3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cln8Q9QUK3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cln8Q9QUK3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cln8Q9QUK3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cln8Q9QUK3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cln8Q9QUK3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cln8Q9QUK3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cln8Q9QUK3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cln8Q9QUK3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cln8Q9QUK3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cln8Q9QUK3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cln8Q9QUK3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cln8Q9QUK3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cln8Q9QUK3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cln8Q9QUK3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cln8Q9QUK3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cln8Q9QUK3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cln8Q9QUK3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cln8Q9QUK3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cln8Q9QUK3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cln8Q9QUK3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cln8Q9QUK3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cln8Q9QUK3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cln8Q9QUK3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cln8Q9QUK3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cln8Q9QUK3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cln8Q9QUK3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cln8Q9QUK3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cln8Q9QUK3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cln8Q9QUK3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cln8Q9QUK3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cln8Q9QUK3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cln8Q9QUK3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cln8Q9QUK3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cln8Q9QUK3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cln8Q9QUK3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cln8Q9QUK3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cln8Q9QUK3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cln8Q9QUK3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cln8Q9QUK3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cln8Q9QUK3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cln8Q9QUK3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cln8Q9QUK3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cln8Q9QUK3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cln8Q9QUK3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms