Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cdkl2Q9QUK0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cdkl2Q9QUK0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cdkl2Q9QUK0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Cdkl2Q9QUK0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cdkl2Q9QUK0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cdkl2Q9QUK0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cdkl2Q9QUK0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cdkl2Q9QUK0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cdkl2Q9QUK0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cdkl2Q9QUK0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cdkl2Q9QUK0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cdkl2Q9QUK0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cdkl2Q9QUK0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Cdkl2Q9QUK0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Cdkl2Q9QUK0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cdkl2Q9QUK0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cdkl2Q9QUK0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Cdkl2Q9QUK0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cdkl2Q9QUK0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cdkl2Q9QUK0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cdkl2Q9QUK0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cdkl2Q9QUK0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cdkl2Q9QUK0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cdkl2Q9QUK0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cdkl2Q9QUK0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cdkl2Q9QUK0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cdkl2Q9QUK0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cdkl2Q9QUK0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cdkl2Q9QUK0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cdkl2Q9QUK0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Cdkl2Q9QUK0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cdkl2Q9QUK0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cdkl2Q9QUK0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cdkl2Q9QUK0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cdkl2Q9QUK0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cdkl2Q9QUK0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cdkl2Q9QUK0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cdkl2Q9QUK0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cdkl2Q9QUK0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cdkl2Q9QUK0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cdkl2Q9QUK0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cdkl2Q9QUK0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cdkl2Q9QUK0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cdkl2Q9QUK0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cdkl2Q9QUK0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cdkl2Q9QUK0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cdkl2Q9QUK0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cdkl2Q9QUK0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cdkl2Q9QUK0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cdkl2Q9QUK0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cdkl2Q9QUK0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cdkl2Q9QUK0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cdkl2Q9QUK0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cdkl2Q9QUK0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cdkl2Q9QUK0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cdkl2Q9QUK0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cdkl2Q9QUK0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cdkl2Q9QUK0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cdkl2Q9QUK0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cdkl2Q9QUK0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cdkl2Q9QUK0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cdkl2Q9QUK0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cdkl2Q9QUK0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cdkl2Q9QUK0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cdkl2Q9QUK0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cdkl2Q9QUK0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cdkl2Q9QUK0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cdkl2Q9QUK0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cdkl2Q9QUK0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cdkl2Q9QUK0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cdkl2Q9QUK0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cdkl2Q9QUK0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cdkl2Q9QUK0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cdkl2Q9QUK0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cdkl2Q9QUK0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Cdkl2Q9QUK0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cdkl2Q9QUK0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cdkl2Q9QUK0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cdkl2Q9QUK0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cdkl2Q9QUK0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cdkl2Q9QUK0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cdkl2Q9QUK0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cdkl2Q9QUK0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cdkl2Q9QUK0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cdkl2Q9QUK0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cdkl2Q9QUK0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cdkl2Q9QUK0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cdkl2Q9QUK0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cdkl2Q9QUK0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cdkl2Q9QUK0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cdkl2Q9QUK0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cdkl2Q9QUK0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cdkl2Q9QUK0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cdkl2Q9QUK0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cdkl2Q9QUK0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cdkl2Q9QUK0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Cdkl2Q9QUK0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cdkl2Q9QUK0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cdkl2Q9QUK0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms