Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rabgef1Q9JM13 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rabgef1Q9JM13 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rabgef1Q9JM13 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rabgef1Q9JM13 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rabgef1Q9JM13 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rabgef1Q9JM13 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Rabgef1Q9JM13 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rabgef1Q9JM13 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rabgef1Q9JM13 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rabgef1Q9JM13 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rabgef1Q9JM13 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rabgef1Q9JM13 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rabgef1Q9JM13 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rabgef1Q9JM13 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rabgef1Q9JM13 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rabgef1Q9JM13 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rabgef1Q9JM13 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rabgef1Q9JM13 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rabgef1Q9JM13 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rabgef1Q9JM13 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rabgef1Q9JM13 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rabgef1Q9JM13 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rabgef1Q9JM13 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rabgef1Q9JM13 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rabgef1Q9JM13 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rabgef1Q9JM13 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rabgef1Q9JM13 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rabgef1Q9JM13 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rabgef1Q9JM13 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rabgef1Q9JM13 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rabgef1Q9JM13 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rabgef1Q9JM13 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rabgef1Q9JM13 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rabgef1Q9JM13 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rabgef1Q9JM13 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rabgef1Q9JM13 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rabgef1Q9JM13 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rabgef1Q9JM13 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rabgef1Q9JM13 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rabgef1Q9JM13 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rabgef1Q9JM13 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rabgef1Q9JM13 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rabgef1Q9JM13 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rabgef1Q9JM13 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rabgef1Q9JM13 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rabgef1Q9JM13 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rabgef1Q9JM13 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rabgef1Q9JM13 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rabgef1Q9JM13 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Rabgef1Q9JM13 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Rabgef1Q9JM13 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rabgef1Q9JM13 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rabgef1Q9JM13 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rabgef1Q9JM13 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rabgef1Q9JM13 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Rabgef1Q9JM13 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rabgef1Q9JM13 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rabgef1Q9JM13 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rabgef1Q9JM13 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Rabgef1Q9JM13 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rabgef1Q9JM13 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rabgef1Q9JM13 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rabgef1Q9JM13 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rabgef1Q9JM13 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rabgef1Q9JM13 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rabgef1Q9JM13 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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Rabgef1Q9JM13 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rabgef1Q9JM13 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rabgef1Q9JM13 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rabgef1Q9JM13 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rabgef1Q9JM13 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rabgef1Q9JM13 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rabgef1Q9JM13 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rabgef1Q9JM13 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Rabgef1Q9JM13 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rabgef1Q9JM13 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rabgef1Q9JM13 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rabgef1Q9JM13 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rabgef1Q9JM13 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rabgef1Q9JM13 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rabgef1Q9JM13 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rabgef1Q9JM13 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rabgef1Q9JM13 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rabgef1Q9JM13 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rabgef1Q9JM13 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rabgef1Q9JM13 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rabgef1Q9JM13 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rabgef1Q9JM13 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rabgef1Q9JM13 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rabgef1Q9JM13 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rabgef1Q9JM13 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rabgef1Q9JM13 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rabgef1Q9JM13 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rabgef1Q9JM13 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rabgef1Q9JM13 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rabgef1Q9JM13 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rabgef1Q9JM13 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rabgef1Q9JM13 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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