Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Higd1aQ9JLR9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Higd1aQ9JLR9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Higd1aQ9JLR9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Higd1aQ9JLR9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Higd1aQ9JLR9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Higd1aQ9JLR9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Higd1aQ9JLR9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Higd1aQ9JLR9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Higd1aQ9JLR9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Higd1aQ9JLR9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Higd1aQ9JLR9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Higd1aQ9JLR9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Higd1aQ9JLR9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Higd1aQ9JLR9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Higd1aQ9JLR9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Higd1aQ9JLR9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Higd1aQ9JLR9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Higd1aQ9JLR9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Higd1aQ9JLR9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Higd1aQ9JLR9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Higd1aQ9JLR9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Higd1aQ9JLR9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Higd1aQ9JLR9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Higd1aQ9JLR9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Higd1aQ9JLR9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Higd1aQ9JLR9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Higd1aQ9JLR9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Higd1aQ9JLR9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Higd1aQ9JLR9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Higd1aQ9JLR9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Higd1aQ9JLR9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Higd1aQ9JLR9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Higd1aQ9JLR9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Higd1aQ9JLR9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Higd1aQ9JLR9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Higd1aQ9JLR9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Higd1aQ9JLR9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Higd1aQ9JLR9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Higd1aQ9JLR9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Higd1aQ9JLR9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Higd1aQ9JLR9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Higd1aQ9JLR9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Higd1aQ9JLR9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Higd1aQ9JLR9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Higd1aQ9JLR9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Higd1aQ9JLR9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Higd1aQ9JLR9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Higd1aQ9JLR9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Higd1aQ9JLR9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Higd1aQ9JLR9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Higd1aQ9JLR9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Higd1aQ9JLR9 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Higd1aQ9JLR9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Higd1aQ9JLR9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Higd1aQ9JLR9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Higd1aQ9JLR9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Higd1aQ9JLR9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Higd1aQ9JLR9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Higd1aQ9JLR9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Higd1aQ9JLR9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Higd1aQ9JLR9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Higd1aQ9JLR9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Higd1aQ9JLR9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Higd1aQ9JLR9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Higd1aQ9JLR9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Higd1aQ9JLR9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Higd1aQ9JLR9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Higd1aQ9JLR9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Higd1aQ9JLR9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Higd1aQ9JLR9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Higd1aQ9JLR9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Higd1aQ9JLR9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Higd1aQ9JLR9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Higd1aQ9JLR9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Higd1aQ9JLR9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Higd1aQ9JLR9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Higd1aQ9JLR9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Higd1aQ9JLR9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Higd1aQ9JLR9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Higd1aQ9JLR9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Higd1aQ9JLR9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Higd1aQ9JLR9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Higd1aQ9JLR9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Higd1aQ9JLR9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Higd1aQ9JLR9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Higd1aQ9JLR9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Higd1aQ9JLR9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Higd1aQ9JLR9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Higd1aQ9JLR9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Higd1aQ9JLR9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Higd1aQ9JLR9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Higd1aQ9JLR9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Higd1aQ9JLR9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Higd1aQ9JLR9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Higd1aQ9JLR9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Higd1aQ9JLR9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Higd1aQ9JLR9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Higd1aQ9JLR9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Higd1aQ9JLR9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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