Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL95

Prg3, Proteoglycan 3, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg3Q9JL95 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prg3Q9JL95 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prg3Q9JL95 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prg3Q9JL95 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prg3Q9JL95 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Prg3Q9JL95 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prg3Q9JL95 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prg3Q9JL95 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prg3Q9JL95 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prg3Q9JL95 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prg3Q9JL95 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prg3Q9JL95 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prg3Q9JL95 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prg3Q9JL95 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prg3Q9JL95 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Prg3Q9JL95 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prg3Q9JL95 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prg3Q9JL95 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prg3Q9JL95 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prg3Q9JL95 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prg3Q9JL95 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prg3Q9JL95 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prg3Q9JL95 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prg3Q9JL95 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prg3Q9JL95 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prg3Q9JL95 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prg3Q9JL95 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prg3Q9JL95 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prg3Q9JL95 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prg3Q9JL95 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prg3Q9JL95 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prg3Q9JL95 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prg3Q9JL95 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prg3Q9JL95 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prg3Q9JL95 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prg3Q9JL95 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prg3Q9JL95 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Prg3Q9JL95 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Prg3Q9JL95 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prg3Q9JL95 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prg3Q9JL95 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prg3Q9JL95 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prg3Q9JL95 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prg3Q9JL95 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prg3Q9JL95 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prg3Q9JL95 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prg3Q9JL95 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prg3Q9JL95 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prg3Q9JL95 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prg3Q9JL95 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prg3Q9JL95 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prg3Q9JL95 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prg3Q9JL95 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Prg3Q9JL95 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Prg3Q9JL95 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prg3Q9JL95 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prg3Q9JL95 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prg3Q9JL95 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prg3Q9JL95 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prg3Q9JL95 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prg3Q9JL95 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prg3Q9JL95 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prg3Q9JL95 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prg3Q9JL95 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prg3Q9JL95 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prg3Q9JL95 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prg3Q9JL95 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prg3Q9JL95 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prg3Q9JL95 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prg3Q9JL95 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prg3Q9JL95 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Prg3Q9JL95 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prg3Q9JL95 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prg3Q9JL95 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prg3Q9JL95 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prg3Q9JL95 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prg3Q9JL95 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Prg3Q9JL95 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prg3Q9JL95 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Prg3Q9JL95 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Prg3Q9JL95 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prg3Q9JL95 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prg3Q9JL95 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prg3Q9JL95 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prg3Q9JL95 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prg3Q9JL95 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prg3Q9JL95 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prg3Q9JL95 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prg3Q9JL95 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prg3Q9JL95 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Prg3Q9JL95 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prg3Q9JL95 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Prg3Q9JL95 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prg3Q9JL95 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prg3Q9JL95 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prg3Q9JL95 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prg3Q9JL95 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prg3Q9JL95 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prg3Q9JL95 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prg3Q9JL95 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms