Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Scamp4Q9JKV5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Scamp4Q9JKV5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Scamp4Q9JKV5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Scamp4Q9JKV5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Scamp4Q9JKV5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Scamp4Q9JKV5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Scamp4Q9JKV5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Scamp4Q9JKV5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Scamp4Q9JKV5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Scamp4Q9JKV5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Scamp4Q9JKV5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Scamp4Q9JKV5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Scamp4Q9JKV5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Scamp4Q9JKV5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Scamp4Q9JKV5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Scamp4Q9JKV5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Scamp4Q9JKV5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Scamp4Q9JKV5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Scamp4Q9JKV5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Scamp4Q9JKV5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Scamp4Q9JKV5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Scamp4Q9JKV5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Scamp4Q9JKV5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Scamp4Q9JKV5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Scamp4Q9JKV5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Scamp4Q9JKV5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Scamp4Q9JKV5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Scamp4Q9JKV5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Scamp4Q9JKV5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Scamp4Q9JKV5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Scamp4Q9JKV5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Scamp4Q9JKV5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Scamp4Q9JKV5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Scamp4Q9JKV5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Scamp4Q9JKV5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Scamp4Q9JKV5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Scamp4Q9JKV5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Scamp4Q9JKV5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Scamp4Q9JKV5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Scamp4Q9JKV5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Scamp4Q9JKV5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Scamp4Q9JKV5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Scamp4Q9JKV5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Scamp4Q9JKV5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Scamp4Q9JKV5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Scamp4Q9JKV5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Scamp4Q9JKV5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Scamp4Q9JKV5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Scamp4Q9JKV5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Scamp4Q9JKV5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Scamp4Q9JKV5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Scamp4Q9JKV5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Scamp4Q9JKV5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Scamp4Q9JKV5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Scamp4Q9JKV5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Scamp4Q9JKV5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Scamp4Q9JKV5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Scamp4Q9JKV5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Scamp4Q9JKV5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Scamp4Q9JKV5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Scamp4Q9JKV5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Scamp4Q9JKV5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Scamp4Q9JKV5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Scamp4Q9JKV5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Scamp4Q9JKV5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Scamp4Q9JKV5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Scamp4Q9JKV5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Scamp4Q9JKV5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Scamp4Q9JKV5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Scamp4Q9JKV5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Scamp4Q9JKV5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Scamp4Q9JKV5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Scamp4Q9JKV5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Scamp4Q9JKV5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Scamp4Q9JKV5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Scamp4Q9JKV5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Scamp4Q9JKV5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Scamp4Q9JKV5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Scamp4Q9JKV5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Scamp4Q9JKV5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Scamp4Q9JKV5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Scamp4Q9JKV5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Scamp4Q9JKV5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Scamp4Q9JKV5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Scamp4Q9JKV5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Scamp4Q9JKV5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Scamp4Q9JKV5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Scamp4Q9JKV5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Scamp4Q9JKV5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Scamp4Q9JKV5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Scamp4Q9JKV5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Scamp4Q9JKV5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Scamp4Q9JKV5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Scamp4Q9JKV5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Scamp4Q9JKV5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Scamp4Q9JKV5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Scamp4Q9JKV5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Scamp4Q9JKV5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Scamp4Q9JKV5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms