Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cyp39a1Q9JKJ9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cyp39a1Q9JKJ9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cyp39a1Q9JKJ9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cyp39a1Q9JKJ9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cyp39a1Q9JKJ9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cyp39a1Q9JKJ9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cyp39a1Q9JKJ9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cyp39a1Q9JKJ9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cyp39a1Q9JKJ9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cyp39a1Q9JKJ9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cyp39a1Q9JKJ9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cyp39a1Q9JKJ9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cyp39a1Q9JKJ9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cyp39a1Q9JKJ9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cyp39a1Q9JKJ9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cyp39a1Q9JKJ9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cyp39a1Q9JKJ9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cyp39a1Q9JKJ9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cyp39a1Q9JKJ9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyp39a1Q9JKJ9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyp39a1Q9JKJ9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyp39a1Q9JKJ9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyp39a1Q9JKJ9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyp39a1Q9JKJ9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyp39a1Q9JKJ9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyp39a1Q9JKJ9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyp39a1Q9JKJ9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyp39a1Q9JKJ9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyp39a1Q9JKJ9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyp39a1Q9JKJ9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyp39a1Q9JKJ9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cyp39a1Q9JKJ9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cyp39a1Q9JKJ9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cyp39a1Q9JKJ9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cyp39a1Q9JKJ9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cyp39a1Q9JKJ9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cyp39a1Q9JKJ9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cyp39a1Q9JKJ9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cyp39a1Q9JKJ9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cyp39a1Q9JKJ9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cyp39a1Q9JKJ9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cyp39a1Q9JKJ9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cyp39a1Q9JKJ9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cyp39a1Q9JKJ9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cyp39a1Q9JKJ9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cyp39a1Q9JKJ9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cyp39a1Q9JKJ9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cyp39a1Q9JKJ9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cyp39a1Q9JKJ9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cyp39a1Q9JKJ9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cyp39a1Q9JKJ9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cyp39a1Q9JKJ9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cyp39a1Q9JKJ9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cyp39a1Q9JKJ9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cyp39a1Q9JKJ9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cyp39a1Q9JKJ9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cyp39a1Q9JKJ9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cyp39a1Q9JKJ9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cyp39a1Q9JKJ9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cyp39a1Q9JKJ9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cyp39a1Q9JKJ9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cyp39a1Q9JKJ9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cyp39a1Q9JKJ9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cyp39a1Q9JKJ9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cyp39a1Q9JKJ9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyp39a1Q9JKJ9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyp39a1Q9JKJ9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyp39a1Q9JKJ9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyp39a1Q9JKJ9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyp39a1Q9JKJ9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyp39a1Q9JKJ9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyp39a1Q9JKJ9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyp39a1Q9JKJ9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyp39a1Q9JKJ9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyp39a1Q9JKJ9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyp39a1Q9JKJ9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyp39a1Q9JKJ9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyp39a1Q9JKJ9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyp39a1Q9JKJ9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyp39a1Q9JKJ9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyp39a1Q9JKJ9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyp39a1Q9JKJ9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp39a1Q9JKJ9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp39a1Q9JKJ9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp39a1Q9JKJ9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp39a1Q9JKJ9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp39a1Q9JKJ9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp39a1Q9JKJ9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms