Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Scamp5Q9JKD3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scamp5Q9JKD3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scamp5Q9JKD3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scamp5Q9JKD3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scamp5Q9JKD3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scamp5Q9JKD3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scamp5Q9JKD3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scamp5Q9JKD3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scamp5Q9JKD3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scamp5Q9JKD3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scamp5Q9JKD3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scamp5Q9JKD3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scamp5Q9JKD3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scamp5Q9JKD3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scamp5Q9JKD3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scamp5Q9JKD3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Scamp5Q9JKD3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Scamp5Q9JKD3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Scamp5Q9JKD3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Scamp5Q9JKD3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Scamp5Q9JKD3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Scamp5Q9JKD3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Scamp5Q9JKD3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Scamp5Q9JKD3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Scamp5Q9JKD3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Scamp5Q9JKD3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Scamp5Q9JKD3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Scamp5Q9JKD3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scamp5Q9JKD3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scamp5Q9JKD3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scamp5Q9JKD3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scamp5Q9JKD3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scamp5Q9JKD3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scamp5Q9JKD3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scamp5Q9JKD3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scamp5Q9JKD3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scamp5Q9JKD3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scamp5Q9JKD3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scamp5Q9JKD3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scamp5Q9JKD3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scamp5Q9JKD3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scamp5Q9JKD3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scamp5Q9JKD3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scamp5Q9JKD3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scamp5Q9JKD3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Scamp5Q9JKD3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Scamp5Q9JKD3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Scamp5Q9JKD3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Scamp5Q9JKD3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Scamp5Q9JKD3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Scamp5Q9JKD3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Scamp5Q9JKD3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Scamp5Q9JKD3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Scamp5Q9JKD3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Scamp5Q9JKD3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Scamp5Q9JKD3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Scamp5Q9JKD3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scamp5Q9JKD3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scamp5Q9JKD3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scamp5Q9JKD3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scamp5Q9JKD3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scamp5Q9JKD3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scamp5Q9JKD3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scamp5Q9JKD3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scamp5Q9JKD3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scamp5Q9JKD3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scamp5Q9JKD3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scamp5Q9JKD3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scamp5Q9JKD3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scamp5Q9JKD3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Scamp5Q9JKD3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Scamp5Q9JKD3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Scamp5Q9JKD3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Scamp5Q9JKD3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Scamp5Q9JKD3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scamp5Q9JKD3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scamp5Q9JKD3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scamp5Q9JKD3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Scamp5Q9JKD3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Scamp5Q9JKD3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scamp5Q9JKD3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scamp5Q9JKD3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scamp5Q9JKD3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scamp5Q9JKD3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scamp5Q9JKD3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scamp5Q9JKD3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scamp5Q9JKD3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scamp5Q9JKD3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scamp5Q9JKD3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scamp5Q9JKD3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scamp5Q9JKD3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scamp5Q9JKD3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scamp5Q9JKD3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scamp5Q9JKD3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Scamp5Q9JKD3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Scamp5Q9JKD3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scamp5Q9JKD3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scamp5Q9JKD3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scamp5Q9JKD3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms