Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR9

Nrip3, Nuclear receptor-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip3Q9JJR9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nrip3Q9JJR9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nrip3Q9JJR9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nrip3Q9JJR9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nrip3Q9JJR9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nrip3Q9JJR9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nrip3Q9JJR9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nrip3Q9JJR9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nrip3Q9JJR9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nrip3Q9JJR9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nrip3Q9JJR9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nrip3Q9JJR9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nrip3Q9JJR9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nrip3Q9JJR9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nrip3Q9JJR9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nrip3Q9JJR9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nrip3Q9JJR9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nrip3Q9JJR9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nrip3Q9JJR9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nrip3Q9JJR9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nrip3Q9JJR9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nrip3Q9JJR9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nrip3Q9JJR9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nrip3Q9JJR9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nrip3Q9JJR9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nrip3Q9JJR9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nrip3Q9JJR9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nrip3Q9JJR9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nrip3Q9JJR9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nrip3Q9JJR9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nrip3Q9JJR9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nrip3Q9JJR9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nrip3Q9JJR9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nrip3Q9JJR9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nrip3Q9JJR9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nrip3Q9JJR9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nrip3Q9JJR9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nrip3Q9JJR9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nrip3Q9JJR9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nrip3Q9JJR9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Nrip3Q9JJR9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nrip3Q9JJR9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nrip3Q9JJR9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nrip3Q9JJR9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nrip3Q9JJR9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nrip3Q9JJR9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nrip3Q9JJR9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nrip3Q9JJR9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nrip3Q9JJR9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nrip3Q9JJR9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nrip3Q9JJR9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nrip3Q9JJR9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nrip3Q9JJR9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nrip3Q9JJR9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nrip3Q9JJR9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nrip3Q9JJR9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nrip3Q9JJR9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nrip3Q9JJR9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nrip3Q9JJR9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nrip3Q9JJR9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nrip3Q9JJR9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nrip3Q9JJR9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nrip3Q9JJR9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nrip3Q9JJR9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nrip3Q9JJR9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nrip3Q9JJR9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nrip3Q9JJR9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nrip3Q9JJR9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nrip3Q9JJR9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nrip3Q9JJR9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nrip3Q9JJR9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nrip3Q9JJR9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nrip3Q9JJR9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nrip3Q9JJR9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nrip3Q9JJR9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nrip3Q9JJR9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nrip3Q9JJR9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nrip3Q9JJR9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nrip3Q9JJR9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nrip3Q9JJR9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nrip3Q9JJR9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nrip3Q9JJR9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nrip3Q9JJR9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nrip3Q9JJR9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nrip3Q9JJR9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nrip3Q9JJR9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nrip3Q9JJR9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nrip3Q9JJR9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nrip3Q9JJR9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nrip3Q9JJR9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nrip3Q9JJR9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nrip3Q9JJR9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nrip3Q9JJR9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nrip3Q9JJR9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nrip3Q9JJR9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nrip3Q9JJR9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nrip3Q9JJR9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nrip3Q9JJR9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nrip3Q9JJR9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nrip3Q9JJR9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms