Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR7

Ascl3, Achaete-scute homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl3Q9JJR7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ascl3Q9JJR7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ascl3Q9JJR7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ascl3Q9JJR7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ascl3Q9JJR7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ascl3Q9JJR7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ascl3Q9JJR7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ascl3Q9JJR7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ascl3Q9JJR7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ascl3Q9JJR7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ascl3Q9JJR7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ascl3Q9JJR7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ascl3Q9JJR7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ascl3Q9JJR7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ascl3Q9JJR7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ascl3Q9JJR7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ascl3Q9JJR7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ascl3Q9JJR7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ascl3Q9JJR7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ascl3Q9JJR7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ascl3Q9JJR7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ascl3Q9JJR7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ascl3Q9JJR7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ascl3Q9JJR7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ascl3Q9JJR7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ascl3Q9JJR7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ascl3Q9JJR7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ascl3Q9JJR7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ascl3Q9JJR7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ascl3Q9JJR7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ascl3Q9JJR7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ascl3Q9JJR7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ascl3Q9JJR7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ascl3Q9JJR7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ascl3Q9JJR7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ascl3Q9JJR7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ascl3Q9JJR7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ascl3Q9JJR7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ascl3Q9JJR7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ascl3Q9JJR7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ascl3Q9JJR7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ascl3Q9JJR7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ascl3Q9JJR7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ascl3Q9JJR7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ascl3Q9JJR7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ascl3Q9JJR7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ascl3Q9JJR7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ascl3Q9JJR7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ascl3Q9JJR7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ascl3Q9JJR7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ascl3Q9JJR7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ascl3Q9JJR7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ascl3Q9JJR7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ascl3Q9JJR7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ascl3Q9JJR7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ascl3Q9JJR7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ascl3Q9JJR7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ascl3Q9JJR7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ascl3Q9JJR7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ascl3Q9JJR7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ascl3Q9JJR7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ascl3Q9JJR7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ascl3Q9JJR7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ascl3Q9JJR7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ascl3Q9JJR7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ascl3Q9JJR7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ascl3Q9JJR7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ascl3Q9JJR7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ascl3Q9JJR7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ascl3Q9JJR7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ascl3Q9JJR7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ascl3Q9JJR7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ascl3Q9JJR7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ascl3Q9JJR7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ascl3Q9JJR7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ascl3Q9JJR7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ascl3Q9JJR7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ascl3Q9JJR7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ascl3Q9JJR7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ascl3Q9JJR7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ascl3Q9JJR7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ascl3Q9JJR7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ascl3Q9JJR7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ascl3Q9JJR7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ascl3Q9JJR7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ascl3Q9JJR7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ascl3Q9JJR7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ascl3Q9JJR7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ascl3Q9JJR7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ascl3Q9JJR7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ascl3Q9JJR7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ascl3Q9JJR7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ascl3Q9JJR7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ascl3Q9JJR7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ascl3Q9JJR7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ascl3Q9JJR7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ascl3Q9JJR7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ascl3Q9JJR7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ascl3Q9JJR7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ascl3Q9JJR7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 307.4 ms