Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.5 ms